离线服务器中python包的安装

因为网络安全原因我们服务器就是离线状态，只能支持本地上传，因此软件安装和python包的安装都很麻烦，这里记录一下python模块离线安装的方法

首先python包下载地址有两个，我只试过第一个
官方下载网站：

https://pypi.python.org/pypi

其他第三方网站下载：

http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/

安装包一般有两种形式，两种形式安装皆可
1、tar.gz格式的源包
2、whl格式的包（记得下载对应系统支持的）

针对tar.gz下载下来后

tar -xzvf package.tar.gz
cd package
python setup.py install

针对whl需要pip

pip install package.whl

即可。

针对报错，可能会有依赖不存在而抱错
如

Installed /public/home/wangwen_lab/zhangjiexiong/anaconda3/lib/python3.8/site-packages/ont_fast5_api-3.0.0-py3.8.egg
Processing dependencies for ont-fast5-api==3.0.0
Searching for progressbar33>=2.3.1
Reading https://pypi.org/simple/progressbar33/
^Cinterrupted

或者

WARNING: Retrying (Retry(total=0, connect=None, read=None, redirect=None, status=None)) after connection broken by 'NewConnectionError('<pip._vendor.urllib3.connection.HTTPSConnection object at 0x7f8ae26bcc10>: Failed to establish a new connection: [Errno 101] Network is unreachable')': /simple/numpy/
ERROR: Could not find a version that satisfies the requirement numpy==1.18.5 (from fast5mod==1.0.5) (from versions: none)
ERROR: No matching distribution found for numpy==1.18.5 (from fast5mod==1.0.5)

这里我直接ctrl+c了，因为我不可能连的上网站
我们需要去前面的网站里面找到对应的模块，把这个依赖的包下下来，再用上述的方法重新安装一次，如果又碰到依赖报错那就再来一次，报错哪个装哪个，直到最后肯定都会装完的。

如果以上都不行，找一个可以联网的服务器，用conda配置一个环境下来
最后还可以使用conda pack对整个环境进行移植
conda pack -n your_environment
tar -xzf your_environment.tar.gz