VMTK与3Dlicer的爱恨情仇

最新推荐文章于 2024-11-22 17:45:02 发布
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http://download.csdn.net/detail/shisanage999/5132598

此网址有VMTK的教程


VMTK是用于血管分割与三维重建的软件，详细介绍见官网

VMTK早期可以与3D slicer 3结合使用。但是Slicer4后，因为VTK版本的原因，二者无法继续结合，只能各自单独安装。

Slicer3网上如今还有旧的版本。下载了Slicer3.6.3win32与linux版本。linux版本使用失败，win32的版本安装成功后无法联机获取VMTK模块，应该是原网页资源失效了。

Github有VMTK 的Slicer4.2版本


折腾到这里就不继续了，还不如花时间直接学习VMTK呢！

vmtk:血管建模工具包
05-14
介绍 血管建模工具包是用于基于图像的血管建模的3D重建，几何分析，网格生成和表面数据分析的库和工具的集合。 VMTK可以通过其独立接口使用，包括Python或C ++库，或作为医学图像处理平台的扩展。 通过提供具有各种技术能力要求的多个用户界面，VMTK的目标是对医学图像处理感兴趣的任何人都可以使用。 他们是临床医生，研究人员，行业还是教育机构。 入门 教程，开发说明和常规信息可从获得。 如何安装VMTK。 了解如何在vmtk中打开数据集，导航到3D体积并设置图像以进行进一步处理。 了解如何使用Pypes。 教程将指导您完成主要功能。 自动生成的python类引用 自动生成的C ++类参考 VMTK示例的屏幕截图。 简报 关于VMTK的演示。 特征 基于梯度的3D水平集分割 查看“水平集分割”教程，了解如何使用水平集从CT或MR图像重建血管段的3D表面。 // Image seg
VMTK Tutorials
03-12
自己整理的一个关于VMTK的文档，详细介绍了关于VMTK的使用情况。VMTK是一个使用ITK，VTK用于血管结构分割、提取、分析的开源C++库。对三维医学图像处理有兴趣的人可以好好研究一下。
VMTK学习——01.入门
未来可期
03-14 3002
写在这里的初衷，一是备忘，二是希望得到高人指点，三是希望能遇到志同道合的朋友。 目录入门读取和显示图像关于文件名的注释图像格式转换档案格式感兴趣体积（VOI）提取使用Marching Cubes进行表面提取 入门 本教程演示了如何在vmtk中打开数据集，导航到3D体积并设置图像以进行进一步处理。 原始链接：http://www.vmtk.org/documentation/getting-started.html 读取和显示图像 第一步是读取图像并将其显示在屏幕上。vmtkimagereader能够.
VMTK（血管建模工具包）开源项目安装与使用指南
gitblog_00135的博客
10-09 1026
VMTK（血管建模工具包）开源项目安装与使用指南 vmtk the Vascular Modeling Toolkit 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/vm/vmtk ...
VMTK编译时遇到的天坑
stareclipse的博客
03-03 909
vmtk编译时遇到的所有坑。
Windows10完美安装VMTK（血管建模工具包）
未来可期
01-02 2358
写在这里的初衷，一是备忘，二是希望得到高人指点，三是希望能遇到志同道合的朋友。 目录 安装说明： 1）Win10系统上先安装了Anaconda（最好是python 3.6版本）。 2）打开anaconda prompt 3）输入以下命令以创建安装了vmtk的新虚拟环境（将名称“ foo”替换为您要调用的环境）： conda create -n foo -c vmtk python=3.6 itk vtk vmtk 4）请记住，您需要先激活此虚拟环境，然后才能使用该库。使用命令启动环境source a.
VMTK-thesis good.pdf
04-19
根据提供的文件信息，本文将围绕“血管处理软件VMTK”的使用和开发进行详细讲解。本文档描述了一篇关于VMTK界面开发的论文，目的是开发一个工具，以便能够处理医学影像数据，特别是DICOM（数字医学通讯）格式的数据...
vmtk-master.7z
04-19
3. **表面重建**：从二值图像中提取血管中心线后，VMTK能生成平滑的血管表面模型，这在血管几何特性分析和可视化中起到关键作用。 4. **血管拓扑分析**：VMTK提供了对血管树的拓扑结构进行检查和修复的功能，如查找...
OpenQuake_VMTK-0.0.5-py3-none-any.whl
11-05
你可以在命令行中输入python --version或python3 --version来检查是否已安装以及安装的版本。 2、安装pip：pip是Python的包管理工具，用于安装和管理Python包。Python 2.7.9+ 和 Python 3.4+ 版本自带pip。你可以...
OpenQuake_VMTK-0.0.3-py3-none-any.whl
11-05
你可以在命令行中输入python --version或python3 --version来检查是否已安装以及安装的版本。 2、安装pip：pip是Python的包管理工具，用于安装和管理Python包。Python 2.7.9+ 和 Python 3.4+ 版本自带pip。你可以...
VMTK 最新最简单编译（VTK9.3.1+ITK5.4.0）
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m0_47549429的博客
11-22 572
VMTK 编译 VTK9 ITK5.40
VTK(五)---内窥镜漫游（基于VMTK血管中心线提取）
老邹的博客
03-14 2950
在使用VMTK血管中心线提取之后，实现内窥镜的漫游： VTK(四)—VMTK血管中心线提取 本文测试模型： lumen.stl： https://github.com/jackyko1991/Vessel-Centerline-Extraction/tree/master/test_data/right 前言 对提取的中心线进行曲线插值，使得路径平滑，并跟随中心线完成内窥镜的漫游。 实现效果： 代码 CMakeLists.txt: cmake_minimum_required(VERSION 3.5)
Vascular Modeling Toolkit (VMTK) 项目推荐
gitblog_00106的博客
11-06 328
Vascular Modeling Toolkit (VMTK) 项目推荐 vmtk the Vascular Modeling Toolkit 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/vm/vm...
VMTK（1）——安装
weixin_42040046的博客
11-16 4722
VMTK——The Vascular Modeling Toolkit（血管建模工具包）1、安装 官网：http://www.vmtk.org/ 1、安装 http://www.vmtk.org/download/ 版本：VMTK最新版本(1.4.0) 兼容和依赖（Compatibility and Dependencies）： VMTK 1.4+的一般依赖关系由anaconda包管理器自动安装...
VMTK【1】Getting Started
qq_27234457的博客
09-20 3975
%date:2016/9/20 %author:lingling不吃鱼VMTK是直接安装可用的，提前只需要配置python2.7的环境即可，故安装过程不做赘述。 附上官网学习网址： http://www.vmtk.org/documentation/getting-started.html 不习惯看英文的同学且为刚接触医学软件的新手可以结合这篇博客学习。第一步：Reading and dis
Study-VTK：计算图形中心线（利用vmtk）
Beyond欣
01-04 7590
原理 http://lantiga.github.com/media/AntigaPhDThesis.pdf 把模型封闭，选取输入输出点，依次求内切球，圆心为中心线。 /*! * \brief 计算中心线 */ vtkSmartPointer<vtkPolyData> MatUtil::ComputingCenterLines( vtkSmar...
Slicer学习笔记（三十五）slicer学习链接
juluwangriyue的博客
12-31 546
Slicer学习笔记（三十五）slicer学习链接 使用方面： 坐标系：https://www.slicer.org/wiki/Coordinate_systems 模块：https://slicer.readthedocs.io/en/latest/index.html 要求：掌握这几个模块的用法：Volumes、Models、Segmentation、DICOM、Data、Volume rendering、Markups 编程方面： 参考代码： https://www.slicer.org/w
3D Slicer简单三维重建
weixin_44715117的博客
06-18 1万+
前言 本文章使用3D Slicer对输入数据进行三维重建，结合别人的经验以及自己的摸索，写成这一篇文章，只是简单的记录一下自己做过的事情，并没有多少深入的去研究，对一些东西可能理解的不够好，希望读这篇文章的人能够谅解，不喜勿喷。 参考资料 CT图片三维重建方法之3DSlicer篇 临床影像实践 B站视频–血肿及中线测量 补充说明 获取切片的间距，这里我用的是python的代码来实现的，所用的图片是使用LITS数据集由NII文件转为png图片来实现的，NII转PNG图片在我的博客另外一篇文章里面有，这里获取切
3D Slicer：从入门到精通（二）——入门指南
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02-24 1万+
本篇文章包含开始使用3D Slicer所需的信息，包括如何安装和快速开始使用基本功能，以及在哪里找到更多信息。
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