linux中miniconda软件的安装及环境配置

miniconda的安装

1、下载安装包  (-c 若下载中断，可以继续上次的安装，可以省略)

注：可以去镜像网站：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/  找到自己想要安装的版本，我这里选择的是Miniconda3-4.7.12.1-Linux-x86_64.sh

wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-4.7.12.1-Linux-x86_64.sh

2、安装刚刚下载的miniconda3，bash就是运行.sh文件的意思

bash Miniconda3-4.7.12.1-Linux-x86_64.sh

3、类似于重启，重新加载一下配置文件.bashrc

source .bashrc

4、一些基础命令

#查看安装的conda的版本，检验是否安装成功
conda --version 


#查看已安装的包
conda list

5、添加一些镜像，方便后面安装软件时，速度快一点

conda config --add channels genomedk
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes

#查看已配置的镜像
conda config --show

#删除某个镜像源
conda config --remove channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/

以上步骤即为安装miniconda的基本步骤

虚拟环境的安装（以TensorFlow GPU版的安装为例）

1、创建一个新的虚拟环境。其中，python36为虚拟环境的名字，python的版本是3.6（会默认安装最新版本的python3.6版本，如：3.6.11）

conda create -n python36 python=3.6

2、激活环境后，才能进行改环境的一些具体包的安装，如：TensorFlow、pandas

conda activate python36 

conda deactivate  #当激活某个环境后，想停止使用该环境时，可以使用该命令

3、安装cudnn和CUDA、TensorFlow

注：这个需要根据想要安装的TensorFlow的版本，来选择安装的cuda、cudnn的版本（https://tensorflow.google.cn/install/source#gpu_support_2）

其他关于tensorflow对应cuda的兼容版本问题可参考：https://www.jianshu.com/p/1d6a508a8d04 （包括显卡驱动版本）

conda install cudatoolkit=9.0 -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/linux-64/
conda install cudnn=7.1.2 -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/linux-64/

conda install tensorflow-gpu==1.12.0

4、安装其他常用的包

#搜索是否存在某个包，以scikit-learn为例
conda search scikit-learn


#安装指定版本的包
conda install scikit-learn==0.19.1

conda install pandas==0.23.0

conda install matplotlib==2.2.2