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科研 计算机 深度学习 生物信息学 分子
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ZDOCK linux 下载(无需安装)、配置、使用
LD_LIBRARY_PATH 环境变量未配置,请查找相关博客,stackoverflow中有解决办法(本人使用方法1解决无效)提供了解决办法,但是本人无法从博客中提到的下载链接中下载相应的文件,因此重新整理以下解决方法。查找 libmpi.so.0,发现没有这个文件,但是能够找到 libmpi.so。2)结果:生成2000个结果pdb,complex1.1.pdb是得分最高的。修改 libmpi.so 文件为 libmpi.so.0。2)mpiexec命令会报错,需要安装的包:OpenMPI。原创 2024-04-25 22:07:58 · 905 阅读 · 2 评论 -
torchdrug 报错 RuntimeError: Ninja is required to load C++ extensions
【代码】torchdrug 报错 RuntimeError: Ninja is required to load C++ extensions。原创 2024-04-19 13:43:04 · 196 阅读 · 0 评论 -
vscode 连接远程服务器 服务器无法上网 离线配置 .vscode-server
使用vscode连接远程服务器时会自动下载配置.vscode-server文件夹,如果远程服务器无法联网,则需要手动下载2)vscode commit id获取点击导航栏中的Help–>About–>获取commit–>复制到上方网址即可下载文件。原创 2024-04-05 19:56:14 · 1165 阅读 · 0 评论 -
vscode 括号 python函数括号补全
解决方法在setting.json中添加 “python.analysis.completeFunctionParens”: true打开设置;点击图中按钮打开setting.json文件添加 “python.analysis.completeFunctionParens”: true原创 2024-02-04 11:51:40 · 1238 阅读 · 0 评论 -
将word公式转成mathtype公式
通过WINWORD.EXE文件打开word,打开最近文件/打开文件找到想转换公式的word文档,再进行操作。1)网上的修改word的起始位置的方法/拷贝omml2mml.xsl文件的方法都不好用。1)选中一个word公式/直接全文word公式转换。2)点击Mathtype转换公式。原创 2024-01-27 12:18:05 · 4233 阅读 · 0 评论 -
python报错 ModuleNotFoundError: No module named xx
当你尝试导入一个模块时,Python 解释器会按照一定的顺序搜索模块的位置。PYTHONPATH 变量包含一个或多个目录的路径,这些路径是解释器用于查找模块的位置。如果你在执行 Python 脚本时遇到模块导入错误,可能是因为模块所在的路径没有包含在 PYTHONPATH 中。通过设置正确的 PYTHONPATH,你可以确保 Python 解释器能够找到你需要的模块。在路径中新建__init__.py文件,将代码转成一个可引用的模块,该文件可以为空。原创 2024-01-22 18:24:35 · 515 阅读 · 0 评论 -
notepad++去除重复行 python去除重复数据
subset: 指定要考虑的列(或列的组合),即基于哪些列判断是否为重复行。默认为所有列。keep: 控制保留哪个重复行。可选值有:‘first’(默认值): 保留第一次出现的重复行。‘last’: 保留最后一次出现的重复行。False: 删除所有重复行。: 重置索引,以便新的DataFrame具有默认的整数索引。inplace: 是否在原地修改DataFrame,而不是返回一个新的DataFrame。原创 2024-01-14 14:20:21 · 959 阅读 · 0 评论 -
Alphafold2 安装 linux 本地配置 conda配置 非docker
作者配置:cuda113和cudnn804,安装的是:jaxlib-0.3.25+cuda11.cudnn805-cp38-cp38-manylinux2014_x86_64.whl。方法1:打开图2中的各个sh文件可以看到下载网址,复制网址到本地,下载后再传回linux服务器。:pdb_mmcif文件可以直接使用图2中的sh文件下载,它可以断点续传,但是需要wget, rsync, gunzip and tar等工具。图为官网给出的下载后的数据,我们一共需要下载9个文件(解压前)。原创 2023-12-26 21:07:25 · 2194 阅读 · 2 评论 -
vscode debug非用户代码 库代码
【代码】vscode debug非用户代码 库代码。原创 2023-12-06 20:06:22 · 58 阅读 · 0 评论 -
ppt绘图 保存图片 转成pdf 失真 分辨率下降
文件->选项->高级。原创 2023-11-11 11:00:34 · 211 阅读 · 0 评论 -
vscode 创建html生成基础代码
在空白页面输入感叹号!之后回车原创 2023-07-21 18:46:26 · 332 阅读 · 0 评论 -
miniconda安装
【代码】miniconda安装。原创 2023-07-21 17:12:41 · 74 阅读 · 0 评论 -
pycharm 连接远程服务器的两种方式 ssh Remote
(如果已经进入某个项目,可以选择Close Project退出至该页面)在mapping栏下设置本地和远程仓库。原创 2023-07-21 15:54:36 · 3165 阅读 · 0 评论 -
Inkscape 剪裁图片
框住需要裁剪右键“设置裁剪组”点击 文件 - >文档属性 - >缩放页面到内容另存为原创 2023-06-25 20:44:44 · 795 阅读 · 0 评论 -
python 生成随机码
【代码】python 生成随机码。原创 2023-06-15 09:47:51 · 516 阅读 · 0 评论 -
github vscode在线使用 在线阅读代码 代码模式
将网址中的 .com 改成 .dev。原创 2023-06-14 09:55:59 · 186 阅读 · 0 评论