simpleitk在读取dcm格式时存储是xyz形式的,转换为数组后则为zyx.
Simpleitk中图像形式:
使用GetSize()的输出为:(Width, Height, Depth),也即原始SimpleITK数据的存储形式
转换为数组的形式:
使用GetArrayFromImage()方法后,X轴与Z轴发生了对调,输出形状为:(Depth, Height, Width)
Width: 宽度,X轴,矢状面(Sagittal)
Height: 高度,Y轴,冠状面(Coronal)
Depth: 深度, Z轴,横断面(Axial)
代码
import SimpleITK as sitk
path="F:\\mediacldata\\dcmimage\\series-000001"
reader = sitk.ImageSeriesReader()
dicom_names = reader.GetGDCMSeriesFileNames(path)
reader.SetFileNames(dicom_names)
image = reader.Execute()
size = image.GetSize()
print(size)
dcm_numpy=sitk.GetArrayFromImage(image)
print(dcm_numpy.shape)
结果展示: