Whole Slide Image Process and tools-医学图像

最新推荐文章于 2023-06-07 10:50:00 发布
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分类专栏： 计算机视觉 文章标签： 染色归一化 SPCN SPAMS
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/qq_34385827/article/details/106543687
版权

在处理医学图像时经常会遇到切片染色不均衡问题，这也很容易理解，每个医生染色的剂量不同，容易造成颜色深浅不一。所以为了避免颜色不均衡给模型带来误差，通常会使用了一些颜色标准化工具来平衡不同病理图片颜色不一的问题。

https://staintools.readthedocs.io/en/latest/index.html   官方说明

代码调试：

查看官方资料，将spams.trainDL中的iter参数调整，得出的图像与模板图一致，接下来重新去测试find-roi和分类等流程

参考的链接：spams官网

http://spams-devel.gforge.inria.fr/doc-python/html/index.html

SPCN中主要的两个函数：Function spams.trainDL   和  Function spams.lasso

调整了trainDL中的参数iter(参见源码样例demo http://spams-devel.gforge.inria.fr/doc-python/html/doc_spams004.html

 

工具：

StainTools

Tools for stain normalization and augmentation in Python (tested on 3.5). GitHub：
https://github.com/Peter554/StainTools

好用的，希望对大家有帮助

 

 

ziding5827
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