分享一个小玩意 真菌UNITE物种分类数据库

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文章标签： 大数据 数据库
于 2022-06-24 16:48:22 首次发布
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此文件是最新的2021.10.05版本

9a0763a04715407db0147f6300c3acf5.png

sh_refs开头的文件是 代表/参考序列

sh_taxonomy开头的文件是  分类信息

k__Fungi;p__Phylum;c__Class;o__Order;f__Family;g__Genus;s__Species
不过建议使用developer的dynamic的俩文件
 

 

聂小七f
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数据集成到真菌数据库
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UNITE数据库怎么用
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UNITE数据库怎么用首先，从UNITE官网下载数据库，得到一个压缩包拿到后，要将其转化Qiime2可用的，用下面的代码就可以实现：但是，我在做的时候发现，这样注释出来的有很多unassigned，所以，需要对这个库进行训练： UNITE（https://unite.ut.ee）是一个基于网络的真菌分子鉴定数据库和序列管理环境。它的目标是形成正式的真菌条形码——核核糖体内部转录间隔区（ITS）区域，并提供所有～1,000,000公共真菌ITS参考序列。 不过，往往因为网络问题，上不去这个网。 首先，从UNI
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手把手操作——在QIIME2中使用UNITE9.0数据库
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05-28 934
点击蓝字↑↑↑“微生态”，轻松关注不迷路生科云网址：https://www.bioincloud.tech编译：微科盟达达兔，编辑：微科盟小编、江舜尧。微科盟原创微文，欢迎转发转载，转载须注明来源《微生态》公众号。导读真菌是陆地生态系统中非常重要的生物组成部分，但是我们对他的多样性和分布的了解非常有限。为了促进真菌多样性、生物地理学和宏观生态学的进一步研究，本文发布了全球...
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04-27
这意味着它是一个简单界面，比运行速度更快。 另外，我喜欢Unite的界面，我也可能患有严重的NIH综合征。 这段代码基于 。 该工具为vim内部提供了一个非常不错的简单任务系统。 我使用了一段时间，但也需要在vim之外...
UNITE-iviewV1.0.rplib.zip
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