分享一个小玩意 真菌UNITE物种分类数据库

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文章标签： 大数据 数据库
于 2022-06-24 16:48:22 首次发布
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9a0763a04715407db0147f6300c3acf5.png

sh_refs开头的文件是 代表/参考序列

sh_taxonomy开头的文件是  分类信息

k__Fungi;p__Phylum;c__Class;o__Order;f__Family;g__Genus;s__Species
不过建议使用developer的dynamic的俩文件
 

 

聂小七f
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UNITE数据库怎么用
Rosebud的博客
04-13 6080
UNITE数据库怎么用首先，从UNITE官网下载数据库，得到一个压缩包拿到后，要将其转化Qiime2可用的，用下面的代码就可以实现：但是，我在做的时候发现，这样注释出来的有很多unassigned，所以，需要对这个库进行训练： UNITE（https://unite.ut.ee）是一个基于网络的真菌分子鉴定数据库和序列管理环境。它的目标是形成正式的真菌条形码——核核糖体内部转录间隔区（ITS）区域，并提供所有～1,000,000公共真菌ITS参考序列。 不过，往往因为网络问题，上不去这个网。 首先，从UNI
强力推荐：unite-train——加速真菌分类的神器
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强力推荐：unite-train——加速真菌分类的神器 unite-train ???? Qiime2 ITS classifiers for the UNITE database 项目地址: https://gitcode.com/g...
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11-04 4041
上方文章标题要求：包括杂志名缩写(一个词的杂志名不缩写，两个及上用实词首字母)和吸引人且有重要信息的语句，中间用中文冒号(：)分隔注：文中灰色部分（引用格式）为写作说明文字，帮助编辑规范...
【QIIME2】真菌ITS数据库_UNITE9.0在QIIME2中的使用
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手把手操作——在QIIME2中使用UNITE9.0数据库
数据集成到真菌数据库
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数据集成到真菌数据库
NAR：UNITE真菌鉴定ITS数据库——处理未分类和并行分类(数据库文章阅读模板)
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
03-25 9268
上方文章标题要求：包括杂志名缩写(一个词的杂志名不缩写，两个及上用实词首字母)和吸引人且有重要信息的语句，中间用中文冒号(：)分隔 注：文中灰色部分（引用格式）为写作说明文字，帮助编辑规范Markdown语言创造笔记和完成必要的内容，在正式稿件中可删除 目录[TOC]，用于把握全文的层级结构，方便导航；一般分为三级标题；一级为文章标题，二级为摘要、背景、结果、方法和结论等，三级为主要结果...
FungalTraits: 超越FUNGuild的最新真菌表型数据库
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05-29 7153
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Fungal Diversity | 全球土壤真菌群落联合数据集
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
05-28 1079
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Uniport数据库介绍与使用
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12-05 4623
  Uniprot （Universal Protein ）是包含蛋白质序列，功能信息，研究论文索引的蛋白质数据库，整合了包括EBI（ European Bioinformatics Institute），SIB（the Swiss Institute of Bioinformatics），PIR（Protein Information Resource）三大数据库的资源。 EBI（ European Bioinformatics Institute）：欧洲生物信息学研究所（EMBL-EBI）是欧洲生命科
photoshop绘制一个逼真的价格标签.docx
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在本篇Photoshop教程中，我们将学习如何使用Adobe Photoshop软件绘制一个逼真的价格标签。教程主要涉及以下几个关键知识点： 1. **网格与对齐到网格功能**：在开始绘制前，开启网格和对齐到网格的功能能帮助我们...
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【例0591】create and unite 3 blocks 创建并合并3个块
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FUNGulid = Fungi + Functional + Guild , 是一个真菌的功能注释的数据库，目前数据库中涵盖了超过12000个真菌的功能注释信息； 网址如下： http://www.stbates.org/guilds/app.php 对于数据库而言，最直接的就是看一下数据库中存储的字段信息； 点击下面的链接，可以返回FUNGuild 数据库中所有的记录，返回的文件格式是json...
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为进一步提高《微生物组实验手册》稿件质量，本项目新增大众评审环节。文章在通过同行评审后，采用公众号推送方式分享全文，任何人均可在线提交修改意见。公众号格式显示略有问题，建议电脑端点击文末...
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