DNA对比

 脱氧核糖核酸即常说的DNA,是一类带有遗传信息的生物大分子。它由4种主要的脱氧核苷酸(dAMP、dGMP、dCMT和dTMP)通过磷酸二酯键连接而成。这4种核苷酸可以分别记为:A、G、C、T。


    DNA携带的遗传信息可以用形如:AGGTCGACTCCA.... 的串来表示。DNA在转录复制的过程中可能会发生随机的偏差,这才最终造就了生物的多样性。


    为了简化问题,我们假设,DNA在复制的时候可能出现的偏差是(理论上,对每个碱基被复制时,都可能出现偏差):


  1. 漏掉某个脱氧核苷酸。例如把 AGGT 复制成为:AGT


    2. 错码,例如把 AGGT 复制成了:AGCT


    3. 重码,例如把 AGGT 复制成了:AAGGT




    如果某DNA串a,最少要经过 n 次出错,才能变为DNA串b,则称这两个DNA串的距离为 n。


    例如:AGGTCATATTCC 与 CGGTCATATTC 的距离为 2


    你的任务是:编写程序,找到两个DNA串的距离。




【输入、输出格式要求】


    用户先输入整数n(n<100),表示接下来有2n行数据。


    接下来输入的2n行每2行表示一组要比对的DNA。(每行数据长度<10000)


    程序则输出n行,表示这n组DNA的距离。


    例如:用户输入:
3
AGCTAAGGCCTT
AGCTAAGGCCT
AGCTAAGGCCTT
AGGCTAAGGCCTT
AGCTAAGGCCTT
AGCTTAAGGCTT


    则程序应输出:
1
1
2




【注意】


    请仔细调试!您的程序只有能运行出正确结果的时候才有机会得分!
    
    在评卷时使用的输入数据与试卷中给出的实例数据可能是不同的。


    请把所有函数写在同一个文件中,调试好后,拷贝到【考生文件夹】下对应题号的“解答.txt”中即可。
    
    相关的工程文件不要拷入。
    
    源代码中不能使用诸如绘图、Win32API、中断调用、硬件操作或与操作系统相关的API。
    
    允许使用STL类库,但不能使用MFC或ATL等非ANSI c++标准的类库。


    例如,不能使用CString类型(属于MFC类库),不能使用randomize, random函数(不属于ANSI C++标准)

[cpp]#include<cstdio>
#include<iostream>
#include<algorithm>
#include<cmath>
using namespace std;
int dp[10010][10010];
int fun(string str1,string str2)
{
    int len1=str1.length();
    int len2=str2.length();
    for(int i=0;i<len1;i++)
        dp[i][0]=i;
    for(int j=0;j<len2;j++)
        dp[0][j]=j;
    for(int i=1;i<=len1;i++)
    {
        for(int j=1;j<=len2;j++)
        {
            if(str1[i-1]==str2[j-1])
                dp[i][j]=dp[i-1][j-1];
            else
            {
                dp[i][j]=min(dp[i-1][j]+1,min(dp[i][j-1]+1,dp[i-1][j-1]+1));
            }
        }
    }
    return dp[len1][len2];
}
int main()
{
    string str1,str2;
    int n;
    cin>>n;
    while(n--)
    {
        cin>>str1>>str2;
        cout<<fun(str1,str2)<<endl;
    }
    return 0;
}

[/cpp]
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