【FreeFEM】从入门到精通——一、 FreeFEM安装与常见问题

安装

0、一些准备工作

• 为centos添加存储库，防止找不到一些依赖包

sudo yum install –y epel-release
sudo yum-config-manager --enable epel

EPEL (Extra Packages for Enterprise Linux) 是 Fedora 团队的一个开源和免费的基于社区的存储库项目，它为 Linux 发行版提供 100% 高质量的附加软件包，包括 RHEL (Red Hat Enterprise Linux)、CentOS Stream 、AlmaLinux 和 Rocky Linux。

• 下载FreeFEM源码
  • FreeFEM官网 https://freefem.org/
  • git clone https://github.com/FreeFem/FreeFem-sources.git

1、安装依赖库

• Ubuntu

sudo apt-get install libgsl-dev libhdf5-dev             liblapack-dev libopenmpi-dev freeglut3-dev bison flex patch perl

• Centos

sudo yum install gsl-devel hdf5-devel lapack-devel openmpi-devel freeglut bison flex patch perl

2、安装FreeFEM

• 进入FreeFEM安装包目录

cd FreeFem-sources

• 自动配置，生成configure文件

autoreconf -i

• 配置configure文件

./configure --enable-download --enable-optim     --prefix=/where/you/want/to/have/files/installed 

• 下载FreeFEM依赖的第三方包

./3rdparty/getall -a

• 构建FreeFEM库和可执行文件

make -j<nbProcs> 
make -j<nbProcs> check

• 检查完成后安装可执行文件

make install

3、将可执行目录添加到系统path中

• 直接在命令行输入，只对当前会话有效

export PATH=/where/you/installed/bin:$PATH

• 修改用户目录下的.profile文件，只对该用户有效

# 通过vim等方式在文件中合适位置添加
export PATH=/where/you/installed/bin:$PATH
# 退出编辑文件在命令行输入
source ~/.profile

• 修改/etc/profile文件，在/etc/profile文件的适当位置添加，对所有用户生效

# 通过vim等方式在文件中合适位置添加
export PATH=/where/you/installed/bin:$PATH
# 退出编辑文件在命令行输入
source /etc/profile

QA、报错解决

• error：can’t locate Digest/MD5.pm in @INC(@INC contains : … 安装arpack时遇到错误

  yum -y install perl-Digest-MD5
  附：手动安装arpack https://blog.csdn.net/Kuang2016/article/details/106648285

• error：configure: error: cannot guess build type; you must specify one 安装nlopt时遇到错误，没有指定build的体系结构系统

  进入nlopt目录下，指定 ./configure --build=aarch64-unknown-linux，然后再make && sudo make install

• error: ‘for’ loop initial declarations are only allowed in C99 mode note: use option -std=c99 or -std=gnu99 to compile your code
  gcc支持的C89，不能在for循环条件里面定义参数，在源程序中将定义的语句提前就行

• error：unresolvable R_AARCH64_ADR_PREL_PGHI21 relocation against symbol `stderr@@GLIBC_2.17’ 一些库报错against symbol ‘xxx’,这个是一些编译的冲突，需要在报错的库文件来源进行重新编译
  在报错的库文件源文件内编译选项添加 -fPIC，编译完后进入要安装的软件目录重新make