生信基础-python
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python 画二维密度图并用广义加和模型进行拟合
def twoD_density(x,y,lable,xmin,xmax,ymin,ymax,rmsdn): plt.figure() plt.style.use('ggplot') sns.kdeplot(x, y, shade=True,cbar= True) # 密度图 #plt.xlim(xmin, xmax) #plt.ylim(ymin, ymax) #plt.axvline(x=rmsdn, color='r', linestyle='-').原创 2021-08-16 10:39:08 · 846 阅读 · 0 评论 -
seaborn.distplot 给分布图的柱子加边框
seaborn.distplot的密度分布图的柱子是没有边框的,画出来的柱子重叠在一起后很难看加一句plt.rcParams["patch.force_edgecolor"] = True让图中所有边的颜色设置为true,搞定原创 2021-04-08 17:16:14 · 1248 阅读 · 0 评论 -
python Matplotlib 控制x轴和y轴都为整数
python Matplotlib 控制x轴和y轴都为整数frommatplotlib.tickerimportMaxNLocatorplt.gca().xaxis.set_major_locator(MaxNLocator(integer=True))plt.gca().yaxis.set_major_locator(MaxNLocator(integer=True))搞定原创 2021-04-08 17:08:19 · 18537 阅读 · 5 评论 -
生物信息人需要掌握的最基础liunx知识
文件夹操作1 pwd:path of working directory,输入之后就会显示你目前的目录是什么2 ls:list,列出文件夹与文件3 ls -lh:long format(显示详细信息,如大小,日期,权限),human read(人可以看懂的格式),第一行显示这个文件夹内所有文件的合计大小,日期和时间,最后是完整档名4 cd :change directory,更换工作目录,如cd ...转载 2018-06-04 11:07:39 · 659 阅读 · 2 评论 -
分子动力学系综小结 (转)
系综(ensemble) 是指在一定的宏观条件下(约束条件),大量性质和结构完全相同的、处于各种运动状态的、各自独立的系统的集合。全称为统计系综。系综是用统计方法描述热力学系统的统计规律性时引入的一个基本概念;系综是统计理论的一种表述方式,系综理论使统计物理成为普遍的微观统计理论 ;系综并不是实际的物体,构成系综的系统才是实际物体。约束条件是由一组外加宏观参量来表示。在平衡统计力学范畴下,可以用来...转载 2018-06-09 09:06:54 · 6993 阅读 · 0 评论 -
生物信息学分析常用网站
1. BLAST(核酸蛋白序列比对):https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi2. miRBase(miRNA数据库网站):http://www.mirbase.org/3. PlantCARE(启动子元件分析网站): http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/4. W...转载 2018-06-09 09:07:34 · 24378 阅读 · 3 评论