MPI文件读写(1)

  1. 使用MPI的文件读写函数时,文件需为二进制文件,可以使用代码自己进行格式转换
    示例代码:
//将存储三个数的文本文件转换为二进制文件
int r,c,m;	
FILE *fp = fopen(filein, "r");
fscanf(fp, "%d", &r);
fscanf(fp, "%d", &c);
fscanf(fp, "%d", &m);
fclose(fp);

fp = fopen(fileout, "wb");
fwrite(&r, sizeof(int), 1, fp);
fwrite(&c, sizeof(int), 1, fp);
fwrite(&m, sizeof(int), 1, fp);
fclose(fp);
  1. MPI_File_read_at_allMPI_File_read_at_all
int MPIAPI MPI_File_read_at_all(
        MPI_File     file,                   //文件指针
        MPI_Offset   offset,                 //偏移量
  _Out_ void         *buf,                   //读出的缓冲区地址
        int          count,                  //读出的个数
        MPI_Datatype datatype,               //读的数据类型
  _Out_ MPI_Status   *status        
);
/*使用示例
MPI_File fh; 
MPI_Status status;
MPI_File_read_at_all(fh, offset, array, count, MPI_INT, &status);
*/
//此函数使用时所有进程都同时调用,当某一进程执行完毕后,会阻塞直到所有进程都执行完毕为止
//区别于MPI_File_read_at,此函数不用所有进程都同时调用
//相关的使用还有MPI_File_write_at_all,  MPI_File_write_at
  1. MPI_File_open
int MPIAPI MPI_File_open(
        MPI_Comm comm,      //集合通信子
  _In_  char     *filename, //打开的文件名
        int      amode,     //打开模式,包括读写等
        MPI_Info info,      
  _Out_ MPI_File *newfile   //文件指针
);
//本函数也是组函数,只要一个进程想调用此函数,就需要所有进程都使用了这个函数后程序才能继续运行
/*使用示例
MPI_File_open(MPI_COMM_WORLD, "in", MPI_MODE_RDONLY, MPI_INFO_NULL, &fh);
MPI_File_open(MPI_COMM_WORLD, "out", MPI_MODE_CREATE | MPI_MODE_WRONLY, MPI_INFO_NULL, &fh);
*/
//一般而言,输入输出函数为二进制文件,需要自己进行转换
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在 Fluent 中使用 UDF 读写文件并行化可以通过以下步骤实现: 1. 在 UDF 中使用 MPI 库,将读写文件的代码封装在 MPI 进程中。 2. 使用 Fluent 提供的 parallel I/O API,将读写文件的操作分配到不同的 MPI 进程中,实现并行读写。 具体实现步骤如下: 1. 初始化 MPI 环境,获取当前进程号和总进程数。 ``` #include "mpi.h" MPI_Init(&argc, &argv); int rank, size; MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank); MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size); ``` 2. 使用 MPI 进程将读写文件的操作封装起来。例如,读取文件并计算每行的平均值: ``` double sum = 0; int count = 0; if (rank == 0) { FILE *fp = fopen("input.txt", "r"); char line[100]; while (fgets(line, sizeof(line), fp) != NULL) { double num = atof(line); sum += num; count++; } fclose(fp); } double avg = 0; MPI_Reduce(&sum, &avg, 1, MPI_DOUBLE, MPI_SUM, 0, MPI_COMM_WORLD); if (rank == 0) { avg /= count; printf("Average: %f\n", avg); } ``` 3. 使用 Fluent 提供的 parallel I/O API,将读写文件操作分配到不同的 MPI 进程中。例如,使用 `rpwrite` 函数写入文件: ``` rpwrite("output.txt", "text", strlen("text"), 0, RP_FILE_ASCII); ``` 在这个例子中,`rpwrite` 函数将 "text" 写入名为 "output.txt" 的文件中,第四个参数是写入的偏移量,可以根据需要指定。在 Fluent 中,每个进程都有自己的文件描述符,可以同时写入同一个文件,Fluent 会自动处理并发写入的问题。 4. 在 UDF 中使用 `rpgetsize` 函数获取文件大小,并使用 `rpread` 函数读取文件内容。例如: ``` int size = rpgetsize("input.txt"); char *buffer = malloc(size + 1); memset(buffer, 0, size + 1); rpread("input.txt", buffer, size, 0, RP_FILE_ASCII); ``` 在这个例子中,`rpgetsize` 函数获取 "input.txt" 文件的大小,`rpread` 函数将文件内容读取到 `buffer` 中。 需要注意的是,使用 parallel I/O API 读写文件时,文件路径需要使用绝对路径,否则会出现文件找不到的错误。另外,在使用 parallel I/O API 时,不要使用 C 库中的标准 I/O 函数(如 fopen、fread 等),否则会导致文件锁定和性能下降。

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