NPSE
NPSE 策略计算窗口内所有可能的 k 间隔核苷酸对的出现次数。
特征表示:
f
k
N
P
S
E
=
{
{
A
T
}
0
,
{
A
A
}
0
,
.
.
.
,
{
A
A
}
k
,
.
.
.
,
{
C
C
}
k
}
f^{NPSE}_k=\{\{AT\}_0,\{AA\}_0,...,\{AA\}_k,...,\{CC\}_k\}
fkNPSE={{AT}0,{AA}0,...,{AA}k,...,{CC}k}
变量说明:
k k k:表示窗口大小
{ A A } k \{AA\}_k {AA}k:表示k间隔核苷酸对
特征维度: 16 × ( k + 1 ) 16\times(k+1) 16×(k+1) (表示从无间隔到k间隔拼接)
**k间隔核苷酸对:**在序列“AXXXTXC”中,“AT”是一个三间隔的核苷酸对,“TC”是一个间隔的核苷酸对。