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DADA2+Kraken2分析16s之细菌  DADA2在QIIME2中是以命令行形式呈现,有时候我们不想装QIIME2,但又想用命令行来运行DADA2。那可咋搞?我们可自己封装R代码为命令行,这个方式对于不熟悉代码的人来说效率比较低,我们可以从QIIME2里面把对应的DADA2运行的代码抠出来,点击我即可链接到地址;我们可以看到有run_dada_paired.R和run_dada_single.R两个文件,根据自己需要下载即可,这里以run_dada_paired.R为例。下载后,我们需要修改命令行传

2021-03-18 19:50:47 2434

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2020-04-25 00:52:43 6741 1

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2018-10-12 11:28:47 61622 14

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