XML2JSON
原本xml的格式:
“Group 0”: 图片的有效范围(因为有可能有重复的区域但是没有标注)
“none”:标注的tumor范围
python: lambda
list_x = [1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8]
r = map(lambda x:x*x,list_x)
print(list(r))
-----------------------------------------
输出:
[1, 4, 9, 16, 25, 36, 49, 64]
tissue mask
- numpy
https://blog.csdn.net/u012762410/article/details/78912667 - cv2 显示numpy
转换成 numpy.uint8
annotation type
- PolyAnnotation: 多边形
- Spline:圆滑的曲线的图形
sampled spot generate
np.where: np.where(condition, x, y) 满足条件(condition),输出x,不满足输出y。
np.vstack:按垂直方向(行顺序)堆叠数组构成一个新的数组
np.stack:https://blog.csdn.net/u013019431/article/details/79768219
logging.basicConfig(level=logging.INFO)
- 把mask的位置映射回level 0中
sample_points=(sample_points * 2 ** args.level).astype(np.int32) # considered about factor
In [12]: slide.level_downsamples
Out[12]: (1.0, 2.0, 4.0, 8.0, 16.0, 32.0, 64.0, 128.0, 256.0, 512.0)
patch_gen
- 输入各种文件的位置
- 获得center 文件中的 center位置
- 传入Pool中
pool = Pool(processes=args.num_process)
pool.map(process, opts_list)