ubuntu 16.04 安装gromacs-2016.3（小白经历）

首先Ubuntu是用的win10版本16215.0以上提供的Linux子系统，安装gromacs-2016.3并行版。打开开发者模式，就可以直接在win10商店下载了。由于算是一个小的虚拟系统，所以gromacs不能安装gpu。看了网上很多教程，对小白有一点点不友好，特此记录小白的安装过程。

一、基础软件准备

检查是否有gcc，g++，python。版本尽量还是新一点。

检查方法 ：

软件名 -version

ps：我的Ubuntu并没有自带gcc

下载地址： https://packages.ubuntu.com

在搜索栏输入软件就可以下载了，当时gcc安装的是5.4.0-6ubuntu1，g++建议安装5.x。

1 .python可以使用apt

（有的时候是apt-get，输入后一般会提示操作）

apt install python   

如果报错，可能会提示You might want to run 'apt-get -f install' to correct these. 输入

apt-get -f install

之后就会自动安装。然后再次输入apt install python就可以自动安装了

2 .gcc和g++ 离线 安装

我采用的是下载安装包，dpkg一个一个安装。在上面那个地址，进入后选择适合的gcc安装包（注意名字），64位选择的是amd64。页面中有些红点标识的依赖包，但是不需要都下载。然后解压，用cd命令进入该解压后的文件夹。

wget za.archive.ubuntu.com/ubuntu

tar xvf gcc-4.8.2.tar.bz2 #如果自行下载这行以前可以忽略

cd gcc-5.4.0

./contrib/download_prerequisites

mkdir build

cd build

../configure --prefix=/opt/gcc-5.4.0 --enable-shared --enable-threads=posix --enable-checking=release --enable-languages=c,c++,fortran,java

make 此处可以使用make -j 4进行4核并行编译，提高速度。根据机器配置需要耗费时间不同。

sudo make install

上述代码执行过程程序会报告错误，然后看倒数几行，会写它需要什么软件（比如gcc-5-base，l等），然后在网页中的依赖包寻找，下载。安装语句如下