使用METIS软件包进行图划分

本文详细介绍了如何在Windows环境下安装和使用METIS软件包进行图划分,包括下载METIS和CMake GUI,配置环境变量,用CMake GUI编译METIS,修改gk_arch.h文件,以及在Visual Studio中生成解决方案和调用API进行图划分的步骤。
摘要由CSDN通过智能技术生成

0 前言

图的划分是图数据处理中的重要环节,被广泛应用于诸多领域的优化问题中,例如超大规模集成电路的设计、时空数据库的存储与访问、传输管理和数据挖掘等。高效的图划分算法在大规模图数据的分布式计算中至关重要。在并行计算机上进行大规模图数据处理时,需要将图数据进行划分从而分配至不同的计算节点上,从而尽可能满足各个节点上的负载均衡且计算节点间的通讯代价尽可能小,这就对图划分结果的质量提出了较高的要求。
METIS是由Karypis Lab开发的一个具有强大功能的图切分软件包,用于划分大型不规则图、划分大网格以及计算稀疏矩阵的降填充序(本文只介绍图划分部分)。METIS基于George Karypis等人提出的多级图划分范式[1]实现,它提供了一组独立的命令行程序和应用程序接口(API),可通过C/C++或ForTran程序调用。本文介绍METIS软件包的下载、安装和用于图划分的使用过程。更多内容参考Karypis Lab官网:http://glaros.dtc.umn.edu/gkhome.

1 安装METIS

(1)下载软件包
下载地址:http://glaros.dtc.umn.edu/gkhome/metis/metis/download
软件包:metis-5.1.0.tar.gz
在这里插入图片描述
本页面最下面的Documentation中可以下载详细的使用文档manual.pdf,其中详细介绍了METIS软件包的使用,包括参数含义及输入输出格式等。
在这里插入图片描述

(2)解压软件包
右击软件包,进行解压。
在这里插入图片描述
其中,BUILD-Windows.txt是在Windows下的安装指南,具体内容本文均有涉及。此时,build文件夹为空,后续会在此生成很多文件。
接下来,安装CMake GUI(CMake的图形化界面)来对METIS进行编译。

2 安装CMake GUI

(1)下载安装包
下载地址:https://cmake.org/download/
安装包:cmake-3.18.0-win64-x64.zip (之前看教程让下载.msi版本的,但笔者用该版本总是报错)
在这里插入图片描述
下载后,解压到某个文件夹,地址为全英文命名,便于后续环境变量配置。
(2)配置环境变量
右击“我的电脑”或“此电脑”或“这台电脑”,选择“属性/高级系统设置/环境变量”,点击“系统变量”里的“Path”,选择“编辑”,“新建”变量,输入解压后的cmake文件路径,至“bin”文件夹为止,点击“确定”。
在这里插入图片描述
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(3)双击图标运行
找到“bin”文件夹下的图标,双击打开cmake的GUI界面。
在这里插入图片描述

3 用CMake GUI编译METIS

(1)选择METIS为源代码,输出路径为METIS文件下的build文件夹。
在这里插入图片描述
(2)点击Configure按钮,选择本机安装的VS版本的生成器(!!注意一定要对应版本,否则会编译出错!!),点击Finish按钮,等待一会儿,出现如图所示的Configuring Done。
在这里插入图片描述
(3)点击Generate按钮,出现Generating done,说明编译完成,生成的METIS.sln文件在METIS的Build文件夹中。
在这里插入图片描述
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4 修改gk_arch.h文件

在解压的文件夹metis-5.1.0中打开文件夹GKlib,找到文件gk_arch.h,将图片中的一行代码注释掉,保存并关闭。
在这里插入图片描述

5 用VS生成解决方案

(1)打开VS,选择“文件\打开\项目/解决方案”,打开METIS的Build文件夹下的METIS.sln文件,出现下图。
在这里插入图片描述
(2)修改VS中下图位置的Debug为Release。
在这里插入图片描述
(3)在VS界面左侧的解决方案管理器中,右击ALL_BUILD,选择“生成”,等待生成完成。(若不修改gk_arch.h则会报错)
在这里插入图片描述
至此,METIS工具包安装完成,下面通过示例介绍VS中用C++调用METIS提供的API进行图划分的过程。

6 在VS中进行图划分

(1)在VS中创建一个空项目,新建一个cpp文件,将以下代码复制到新建的cpp文件中。

#include "metis.h"
#inc
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### 回答1: Metis是一个开源的划分工具,可以用于将大型划分成多个子,以便并行处理或者分布式计算。C++语言可以基于Metis库实现划分,具体步骤如下: 1. 安装Metis库,并在C++编译环境中配置Metis库路径。 2. 读取数据,将数据转换成Metis所要求的格式,例如CSR(Compressed Sparse Row)格式。 3. 调用Metis库提供的函数进行划分,例如METIS_PartGraphKway函数,该函数将划分成k个子,其中k为用户指定的参数。 4. 将划分结果保存到文件中或者直接使用内存中的数据。 下面是一个简单的C++代码示例,实现了基于Metis库的划分: ```c++ #include <metis.h> #include <iostream> #include <fstream> #include <vector> using namespace std; int main() { // 读取数据 int nvertices, nedges; ifstream fin("input.txt"); fin >> nvertices >> nedges; vector<int> xadj(nvertices + 1), adjncy(nedges); for (int i = 0; i <= nvertices; i++) fin >> xadj[i]; for (int i = 0; i < nedges; i++) fin >> adjncy[i]; fin.close(); // 调用Metis进行划分 int nparts = 4; // 划分成4个子 vector<int> part(nvertices); int ret = METIS_PartGraphKway(&nvertices, &nparts, xadj.data(), adjncy.data(), NULL, NULL, NULL, &nparts, NULL, NULL, NULL, &part[0]); // 输出划分结果 if (ret == METIS_OK) { ofstream fout("output.txt"); for (int i = 0; i < nvertices; i++) fout << part[i] << endl; fout.close(); } else { cout << "Graph partitioning failed." << endl; } return 0; } ``` 在上面的代码中,我们首先读取了数据,然后调用了METIS_PartGraphKway函数进行划分,并将划分结果保存到了文件中。在实际应用中,可以根据需要对代码进行修改和优化,以得到更好的划分效果。 ### 回答2: C语言基于metis实现划分的步骤如下: 1. 引入头文件:在C程序的开头添加#include <metis.h>来引入metis库的头文件。 2. 创建对象:使用metis库提供的函数METIS_CreateGraph创建一个对象。参数包括的总节点数、的总边数、xadj数组和adjncy数组,分别表示节点之间的连接关系。 3. 设置分割的选项:使用metis库提供的函数METIS_SetDefaultOptions来设置默认的分割选项。也可以通过修改metis库提供的Options结构体的成员来自定义分割的选项。 4. 执行分割:使用metis库提供的函数METIS_PartGraphKway来执行的分割。参数包括对象、希望分割成的部分数目、使用的算法(METIS_PartGraphRecursive或METIS_PartGraphKway),以及一个可选的连续数值的数组(可用于指定初始分区)。 5. 处理分割的结果:metis库会将对象的分割结果存储在一个编号数组中(即part数组)。根据part数组的元素,可以将的节点分成不同的部分。 6. 释放资源:在程序结束前,使用metis库提供的函数METIS_FreeGraph来释放对象所占用的资源。 总结:通过使用metis库提供的函数,我们可以很方便地在C语言中实现划分。只需引入metis库的头文件、创建对象、设置分割选项、执行分割以及处理分割结果即可实现划分。 ### 回答3: 基于metis实现划分指的是使用metis算法对进行划分metis是一种常用的划分工具,通过划分后的可以在多个计算资源上并行处理,从而提高计算效率和并行性。 metis算法主要包含以下几个步骤: 1. 预处理:首先,需要将原始数据转换为metis可以处理的格式,通常是将表示为一个邻接矩阵或邻接表结构。 2. 划分参数设置:决定划分的质量和结果的平衡性等参数,如权重、边的限制等。这些参数可以通过调整来获得最佳的划分结果。 3. 划分算法执行:metis使用一种称为多级划分的方法。它将原始划分为多个较小的子,然后逐级对子进行划分,直到达到所需的划分数量或划分质量。 4. 划分结果评估:metis根据一定的评估标准对划分结果进行评估,包括划分质量、平衡性等指标。可以根据评估结果来调整划分参数和算法选择。 通过metis实现划分可以获得多个子,每个子都包含部分节点和边。这些子可以在并行计算中使用,每个计算资源可以独立处理一个子,从而提高计算效率和并行性。 总结来说,基于metis实现划分可以通过预处理、参数设置、算法执行和结果评估等步骤来实现。这样可以将原始划分为多个子,以提高计算效率和并行性。

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