SimpleITK(持续更新中)

本文介绍了SimpleITK的基本概念,如方向、元信息,并详细列举了多个常用指令,包括读取与写入图像、转换数据类型、图像处理操作等,如ReadImage、ImageSeriesReader、ResampleImageFilter等。
摘要由CSDN通过智能技术生成

(一)概念

1. SimpleITK中的方向

Width: 宽度,X轴,矢状面(Sagittal)

Height: 高度,Y轴,冠状面(Coronal)

Depth: 深度, Z轴,横断面(Axial)

2. 元信息

origin:具有全零索引的体素在世界坐标系中的位置。图像原点的坐标(物理层面的,有单位,一般为mm)

spacing:沿每个维度的像素之间的距离。图像各维度上像素之间的距离(物理层面的,一般为mm)

size:每个维度中的像素数,图像像素个数。

direction:对应于矩阵列的每个轴的方向。采用方向余弦矩阵,也就是图像自身坐标系相对于世界坐标系(固定不动的)的角度,新坐标系在原坐标系上各个方向的投影。

physical extent:图像在物理空间的大小。

(二)常用的指令

1.SimpleITK.ReadImage(path) 读取dicom单个文件

最简单的在path中读取图像信息,一般读取格式为mhd,nii文件与dicom文件。

2.ImageSeriesReader()读取dicom序列文件

Imag

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