解决共线性分析MCScanX软件error: cannot find symbol之报错（GitHub之没解决的issue）

MCScanX软件改进了MCScan算法，在WGDI分析流程中也被用到。

1、下载安装

下载：MCScanX

按照GitHub官网安装操作如下：

代码：

$wget https://github.com/wyp1125/MCScanX/archive/refs/heads/master.zip
$unzip MCscanx.zip
$cd MCScanx
$make

需要注意确认自己环境以包含：

• java编译环境
• Zlib库
• libpng库

2、报错及分析

But make时,出错报错：

查阅相关问题：
circle_plotter.java:232: error: cannot find symbol #17

评论中提到安装JDK8,但对大多数依然没效果。

family_circle_plotter error: cannot find symbol #33
评论提到Javac 先编译 Cubic.java，接着make仍然报错。

几次编译尝试最后清爽解决。
报错问题并不在./MCScanX-master，而是在./MCScanX-masterdownstream_analyses/

3、解决

解决办法：

cd ./MCScanX-masterdownstream_analyses/
javac *.java
cd ../
make