SIMCA判别方法是基于主成分分析的一种模式识别方法。它的基本思路是利用PCA分析建立每个类别的模型,然后计算未知样本与这些模型的距离,根据距离判别方法来确定未知样本属于哪个类别或不属于任何类别。SIMCA方法主要分为三个步骤:首先,通过主成分分析(PCA)对样本进行降维处理,提取出样本中的主要特征;其次,为每个类别建立PCA模型,即利用该类别的样本计算出该类别的主成分;最后,对于未知样本,计算其与每个类别的PCA模型的距离,根据距离进行判别,确定未知样本的类别归属。
PLS-DA是一种有监督的判别分析统计方法,通过建立代谢物表达量与样品类别之间的关系模型,来实现对样品类别的预测。它是结合了偏最小二乘回归(PLS)和判别分析(DA)两种方法的。在PLS-DA中,首先使用偏最小二乘回归方法对样本数据进行降维处理,然后再使用判别分析方法进行分类。
PLS-DA的主要步骤如下:
- 收集包含代谢物表达量和样品类别信息的数据集。
- 对数据进行预处理,如去除噪声、标准化等。
- 使用偏最小二乘回归方法对数据进行降维处理,提取主要的特征。
- 使用判别分析方法建立分类模型,根据提取的特征对样品进行分类。
- 验证和评估模型的性能,如交叉验证、ROC曲线等。