1、 汇编语言
比如:
“ADD”代表数字逻辑上的加减,
“MOV”代表数据传递
2、Needleman-Wunsch算法矩阵
举个例子来说明:
a:GGATCGA
b:GAATTCAGTTA
A=len(a)=7
B=len(b)=11
LCS(A,B)= LCS(7,11)
说明:a的长度为7,b的长度为11。最长公共子序列的表达式就是LCS(7,11)。
-
第一步:初始化动态转移矩阵
-
第二步:计算矩阵的第一行
状态转移方程是:
若A(i)=B(j),LCS(i,j)=LCS(i-1,j-1)+1;
否则
LCS(i,j)=max(LCS(i-1,j-1),LCS(i,j-1),
LCS(i-1,j))=max(LCS(i,j-1),LCS(i-1,j))。
- 第三步:计算矩阵的其余各行
他们的匹配为:
A:GGA_TC_G__A
B:GAATTCAGTTA
回溯算法实际上一个类似枚举的搜索尝试过程,主要是在搜索尝试过程中寻找问题的解,当发现已不满足求解条件时,就“回溯”返回,尝试别的路径。回溯法是一种选优搜索法,按选优条件向前搜索,以达到目标。但当探索到某一步时,发现原先选择并不优或达不到目标,就退回一步重新选择,这种走不通就退回再走的技术为回溯法,而满足回溯条件的某个状态的点称为“回溯点”。
在原有的序列对比算法上添加了一些功能:
输出:
这里是一些代码截图。
放一些输出截图: