重复的DNA序列

所有 DNA 都由一系列缩写为 'A'，'C'，'G' 和 'T' 的核苷酸组成，例如："ACGAATTCCG"。在研究 DNA 时，识别 DNA 中的重复序列有时会对研究非常有帮助。

编写一个函数来找出所有目标子串，目标子串的长度为 10，且在 DNA 字符串 s 中出现次数超过一次。

示例 1：

输入：s = "AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT"
输出：["AAAAACCCCC","CCCCCAAAAA"]
示例 2：

输入：s = "AAAAAAAAAAAAA"
输出：["AAAAAAAAAA"]

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思路：

从0开始往前搜索固定长度的字符串，遇到一个就判断是否和list里面的有重复。有则说明是目标子串，没有，则加入list。

 public static List<String> DNAserial(String str){
      HashSet<String> set = new HashSet<>();
      List<String> list1 = new ArrayList<>();
      List<String> list2 = new ArrayList<>();
      for(int i =0; i < str.length() - 9; i++){
          String temp = str.substring(i,i+10);
          System.out.println(temp);
          if(list1.contains(temp)){
              set.add(temp);
          }else{
              list1.add(temp);
          }
      }
     for(String s : set){
         list2.add(s);
     }
     return list2;
  }
    public static void main(String[] args){
        System.out.println(DNAserial("AAAAACCCCCAAAAACCCCCCAAAAAGGGTTT"));
        System.out.println(DNAserial("AAAAAAAAAAA"));
    }

注意：这里如果结果用list存放，会在出现次数大于2次的时候，需要判断这个子串之前是否已经放入过了，为了避免这个复杂度，可以把结果也用hashset存放，最后用ArrayList的构造方法转一下。

class Solution {
    public List<String> findRepeatedDnaSequences(String s) {
   
  HashSet<String> set = new HashSet<>();
        HashSet<String> set2=  new HashSet<>();
        for(int i =0; i < s.length() -9; i++){
            String temp = s.substring(i,i+10);
        
            if(set2.contains(temp)){
               set.add(temp);
            }
                set2.add(temp);
        }

        return new ArrayList<String>(set);
    }
}