RNA速率 | bam转loom+根据已有的Seurat对象可视化(避坑篇)
(一)velocyto生成loom文件(linux)需要的是标准的基因组gtf注释文件和bam文件。1.1 使用conda 构建一个velocyto软件分析环境#创建velocyto环境conda create -n velocyto #进入velocyto环境conda activate velocyto #安装需要的包conda install samtoolsconda install numpy scipy cython numba matplotlib scikit-learn
原创
2021-11-27 20:56:21 ·
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