一、PhysioNet简介
PhysioNet是一个提供生理信号记录的数据库（PhysioBank）和相关的开源软件（PhysioToolkit）的机构。PhysioBank拥有大量心电信号数据，大部分都是免费提供的，可以从网站上直接下载。
网址链接： https://physionet.org/
图1：PhysioNet网页界面
MIT-BIH Arrhythmia Database就是其中的一个数据库。
图2：PhysioNet数据库
二、MIT-BIH心电数据库（MIT-BIH Arrhythmia Database）
2.1 MIT-BIH数据库简介
由美国麻省理工学院（MIT）和贝斯以色列医院（Beth Israel Hospital）联合建立。这个数据库包含了48个半小时常驻ECG记录，来自47名受试者，记录了各种心律失常现象。这些数据已被广泛用于心律分析研究和心律失常检测器的评估。MIT-BIH数据库的采样频率为360Hz，分辨率为11位，每个记录持续时间超过30分钟，采用Format 212格式存储。此外，该数据库还提供了人工标注的心拍位置和类型信息，方便研究者使用。MIT-BIH数据库是免费提供的，可以通过PhysioNet网站下载。
图3：MIT-BIH Arrhythmia Database 数据示例
2.2 MIT-BIH数据库链接
MIT-BIH Arrhythmia Database MIT-BIH心律失常数据库-概述
MIT-BIH Arrhythmia Database Directory MIT-BIH心律失常数据库-目录
MIT-BIH Arrhythmia Database v1.0.0 MIT-BIH心律失常数据库-数据说明
PhysioBank A，TM MIT-BIH心律失常数据库-在线显示数据
（Tips：MIT-BIH心律失常数据库-在线显示数据的具体内容，在下一篇文章中再继续解释哈。）
2.3 MIT-BIH数据库组成
MIT-BIH数据库中的每个记录由三个文件组成：头文件（.hea）、数据文件（.dat）、注释文件（.atr）。
2.3.1 头文件（.hea）
以ASCII格式存储，包含了记录的元数据，如采集数据的通道数、采样频率、总采集数、记录数据文件的存储格式、增益、偏移、模拟数字转换器的分辨率以及患者指南提到的个人附加信息。
图4：头文件示例（100号记录）
以100.hea的注释信息为例，它提供了记录的基本信息和信号的技术规范。下面是对这些信息的详细解释：
100 2 360 650000
这一行是记录行，包含了心电信号记录的基本描述。
100：这是记录的编号或文件名。
2：表示记录中包含两个采样率为360Hz的信号通道，通常这两个通道是MLII和V5导联。
360：采样率，单位是Hz（赫兹），表示信号每秒采集360次。
650000：每个信号通道的样本数，表示每个通道有650000个采样点。
100.dat 212 200 11 1024 995 -22131 0 MLII
100.dat 212 200 11 1024 1011 20052 0 V5
这两行是信号技术规范说明行，描述了信号的存储格式和一些技术参数。
100.dat：信号存储的文件名。
212：信号以212格式存储，这是一种压缩格式，每三个字节存储两个12位的样本值。 o 200：每个信号的增益，表示每200个ADC（模拟/数字转换器）单位对应1毫伏(mV)的电压变化。
11：ADC的分辨率是11位。
1024：ADC的零值，表示没有输入电压时的ADC输出值。
995和1011：不同信号的第一采样点的值，表示信号起始的采样值。
-22131和20052：65万个采样点的校验数，用于数据完整性的检验。
0：表示输入和输出可以以任意尺寸的块来执行。
MLII和V5：信号描述字段，表示信号采自的导联，MLII是矫正肢体导联II，V5是胸前导联V5。
# 69 M 1085 1629 x1：这是注释字符串，提供了患者的基本信息和记录数据。
69：患者的年龄。
M：患者的性别，M代表男性。
1085和1629：记录的开始和结束时间，或者是与记录相关的其他时间信息。
x1：可能是与记录相关的其他标识信息。
# Aldomet, Inderal：这是另一条注释字符串，列出了患者使用的药物。
Aldomet和Inderal：是患者使用的药物名称。
Aldomet（甲基多巴）是一种中枢性交感神经抑制药，它通过刺激中枢α2受体，抑制交感神经活动，从而降低外周血管阻力和心输出量。
Inderal（盐酸普萘洛尔）是一种β-受体阻断剂，可以降低心肌收缩性、自律性、传导性和兴奋性，减慢心率，减少心输出量和心肌耗氧量。
这些信息对于分析患者的心电信号和诊断心律失常情况很重要，因为某些药物会影响心电信号的形态。
2.3.2 数据文件（.dat）
以二进制格式存储，采用212格式，每三个字节存储两个12位的数值，代表了心电信号的振幅。
图5：数据文件示例（100号记录）
文件格式：212格式意味着每两个字节（16位）存储一个12位的数值。由于一个字节是8位，所以两个字节可以存储16位数据。
数据存储：每三个字节组成一个数据单元，存储两个12位的数值。这意味着每个数据单元占用24位（3字节 * 8位/字节）。
数值表示：由于每个数值是12位，所以它们是以二进制补码形式存储的。这意味着数值的范围是从-2048到+2047（因为12位可以表示的数值范围是2^12 - 1）。
字节序：在二进制文件中，字节序（大端或小端）是非常重要的。大端字节序是指最重要的字节存储在最低的内存地址，而小端字节序则是最重要的字节存储在最高的内存地址。
数据解析：要解析这样的文件，您需要按照每三个字节一组的方式读取数据，然后将每组的前两个字节和后一个字节的前4位组合起来，形成一个12位的数值。由于是212格式，您需要将每组的前两个字节视为一个16位的数值，然后取其高12位作为第一个12位数值，将后一个字节的前4位与前两个字节的低4位组合成第二个12位数值。
示例解析：要解析212格式的心电信号文件，您需要按照每三个字节一组的方式读取数据，并将它们转换为两个12位的十进制数值。以三个字节 E3 33 F3 为例，解析步骤如下：
1、字节拆分与组合：
- 三个字节分别为：
E3（第1字节）、33（第2字节）、F3（第3字节）。 - 取第2字节
33中的前4位（第一个3）移动到第1字节E3的前面，形成3E3（12位）。 - 取第2字节
33中的后4位（第二个3）移动到第3字节F3的后面，形成3F3（12位）。
2、转换为十进制：
3E3 的二进制表示为 001111100011。
即：3E316=3×16^2+E×16^1+3×16^0=3×256+14×16+3×1=768+224+3=995
3F3 的二进制表示为 001111110011。
即：3F316=3×16^2+F×16^1+3×16^0=3×256+15×16+3×1=768+240+3=1011
每组三个字节经过上述操作后，生成的两个12位数值表示心电信号的两个幅值点。这种格式使得每组3字节可以高效存储两个信号幅值点。可依据下列十六进制到十进制的转换结果，验证上述图5中的其他十六进制示例，结果均正确。
图6：十六进制到十进制转换结果（部分展示）
3、调整基线并转换为实际幅值：
- 由于原始信号中包含偏移（以1024为基线），需要减去1024：即：M=M−1024
- 将结果除以200，以获得真实的信号幅值： 即：M=M/200
图7：心电信号真实幅值转换结果（部分展示）
2.3.3 注释文件（.atr）
以二进制格式存储，包含了心电专家对相应心电信号的诊断信息，如心拍位置和类型。
图8：注释文件示例（100号记录）
MIT 格式是一种紧凑型格式，每一注释的长度占用偶数个字节空间，多数情况下是占用两个字节，多用于在线的注释文件。而 AHA 格式的每一注释占用 16 个字节的空间，多用于交换文件的情况。心律失常数据库采用的 MIT 格式。
从文件中的第一字节不为 0 可以判断该文件是以 MIT 格式存储的。
从第一字节开始按照 MIT 格式进行分析，首先读出 16 位值 0x7012 ，其高 6 位的值为 0x 1C ( 十进制 28) ，低 10 位的值为 0x12 ，该类型代码为 28 ，代表意义是节律变化，发生时间在 0.05 秒（ 18/360Hz ）。
接着读出后面的 16 位值 0xFC03 ，其高 6 为的值为 0x 3F （十进制 63 ），低 10 位的值为 0x03 ，该类型代码为 63 ，代表的意义是在该 16 位值后附加了 3 个（低 10 位值代表的数）字节的辅助信息，若字节个数为奇数，则再附加一个字节的空值。
在本例中就是 “28 4E 00 00 ” ，然后再从下一字节读 16 位值 0x043B ，其高 6 位的值为 1 ，低 10 位的值为 0x3B （十进制 59 ），该类型码 1 代表正常心搏，发生时间为 0.213 秒（（ 18+59 ） /360Hz ）；依次类推即可读出所有的注释，当读到的 16 位值为 0 时，就表示到了文件尾。
心电波形与对应的注释标签图如下所示。
图9：心电波形与对应的注释标签（100号记录，前10秒片段）
以上就是MIT-BIH心电数据库概述的全部内容啦。
我们下期再见，拜拜(⭐v⭐) ~
（Ps：有代码实现需求，请见主页信息，谢谢支持！~）
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