![](https://img-blog.csdnimg.cn/20201014180756928.png?x-oss-process=image/resize,m_fixed,h_64,w_64)
linux软件
文章平均质量分 62
谁曾经不是菜鸟啦
认识到菜是解决菜的第一步
展开
-
augustus 软件安装与Docker使用记录
augustus 软件安装与Docker使用记录augustus:一基因预测软件;Docker:应用容器引擎,可实现虚拟机。一. 问题:Github下载的augustus难以正常安装及使用本机系统:CentOS7git clone https://github.com/Gaius-Augustus/Augustus.gitcd Augustusmake augustus## 报错如下:mkdir -p bincd src && makemake[1]: Enterin原创 2021-08-10 15:38:23 · 1177 阅读 · 0 评论 -
plink质控及转换文件、admixture软件学习记录
plink质控及转换文件、admixture软件学习记录目的:自定义ped文件和map文件,用plink质控及转换文件,使用admixture做群体结构学分析。ped文件和map文件根据格式用pandas生成即可。非vcf文件,可按照以下两个文件格式转换数据,再进行后续分析。ped文件格式:一行一个样本,每一列以空格为相隔;前六列为信息列;第一列:家系ID(FID)第二列:个体ID(IID)第三列:父本ID,未知则设为0第四列:母本ID,未知可设为0第五列:性别列,未知设为0第六列:原创 2021-04-13 18:56:52 · 3957 阅读 · 15 评论 -
Trim_Galore的报错问题
使用Trim Galore的报错问题报错信息: cutadapt -j 1 -e 0.1 -q 20 -O 1 -a AGATCGGAAGAGC s50X_1.clean.fq.gzThis is cutadapt 2.10 with Python 3.6.1Command line parameters: -j 1 -e 0.1 -q 20 -O 1 -a AGATCGGAAGAGC s50X_1.clean.fq.gzRun "cutadapt --help" to see command-l原创 2020-09-20 14:22:50 · 1513 阅读 · 0 评论