Trim_Galore的报错问题

使用Trim Galore的报错问题

报错信息：

 cutadapt -j 1 -e 0.1 -q 20 -O 1 -a AGATCGGAAGAGC s50X_1.clean.fq.gz
This is cutadapt 2.10 with Python 3.6.1
Command line parameters: -j 1 -e 0.1 -q 20 -O 1 -a AGATCGGAAGAGC s50X_1.clean.fq.gz
Run "cutadapt --help" to see command-line options.
See https://cutadapt.readthedocs.io/ for full documentation.

cutadapt: error: [Errno 13] Permission denied

cutadapt是python软件，既然是权限问题那么久给足文件权限嘛。但是问题还是没有解决。
谷歌上找了好几圈，有人遇到的报错后面会提示具体的文件或者是依赖包，pigz包的缺失可能是问题原因。

解决办法

yum install pigz

需要root权限。
再次运行即可。