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16s
qq_43340557
这个作者很懒,什么都没留下…
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16s 分析,调整文库顺序
PE250下机数据文库顺序是随机的,Qiime2也没有提供调整文库顺序的方案,故使用Qiime1来调整文库顺序~$ source activate qiime1~$ extract_barcodes.py \-f 1.clean.fq \-r 2.clean.fq \-o outputdict \-c barcode_paired_end \-l 0 \-L 0 \-a \-m...原创 2019-01-02 17:17:05 · 644 阅读 · 0 评论 -
Lefse本地运行并更换颜色
首先是lefse的安装由于lefse使用的环境比较早,建议使用conda虚拟环境的方式安装,可以省掉不少麻烦 conda create -n lefse python=2.7 python=2.7 #python这里选成2.7否则会卡住环境安装完成后,进入环境安装lefse source activate lefse conda install lefse...原创 2019-04-01 13:47:34 · 2659 阅读 · 2 评论