日本水稻(Oryza sativa Japonica rice)的基因组染色质长度 IRGSP-1.0

于 2023-11-16 18:32:39 发布
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分类专栏： 生物信息学 文章标签： 生物信息 染色体长度 UCSC 基因组数据
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本文链接：https://blog.csdn.net/qq_43722079/article/details/134448168
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创作日志： 在看scHi-C综述的时候发现了一个在2021年发布在Nature Plants上的数据集，想拿来用，首先就要知道其对应的水稻品种以及染色质长度。最终在UCSC上找到了对应的组装好的基因组，版本名为 IRGSP-1.0。

UCSC链接：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/datasets/genome/GCF_001433935.1/ 
chr1	43270923
chr2	35937250
chr3	36413819
chr4	35502694
chr5	29958434
chr6	31248787
chr7	29697621
chr8	28443022
chr9	23012720
chr10	23207287	
chr11	29021106	
chr12	27531856

染色质长度在这里看：

在这里插入图片描述

Cian小鱼干
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