超详细无标记动作捕捉Deeplabcut的安装教程

简介：

DeepLabCut 是一个开源的机器学习工具，专门用于动物行为分析中的姿态估计。它利用深度学习技术，能够从视频中自动识别和跟踪多个身体部位或标记点，从而实现对动物行为的精确量化和分析。该工具具有用户友好的界面和强大的定制能力，适用于各种研究领域，如神经科学、行为学和生物医学等。（我需要研究动物的运动学信息，所以需要DLC来进行处理）

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🧸🧸🧸此页面更新历史🧸🧸🧸

2024.9.24——第一版——Deeplabcut2.3.10版本的安装

2024.9.25——第二版——Deeplabcut3.0.0rc1版本的安装

一、📸安装

Deeplabcut官网

👋 DeepLabCut详细教程官网

前提：本篇适合windows系统。官网上其实提供了很多教程，包括安装与使用，虽然很详细但是英文版和有的部分不是很清晰，给初学者带来了很多困扰，包括我自己也踩了很多坑（😭反反复复安装删除很多次），这次终于安装上了，写个文章分享一下教程或者当自己的备忘录。

🔖下面的安装方法前提是已经安装了Anaconda环境管理软件🔖，anaconda的安装与配置教程在主页也有。点击直达

最新版Anaconda新手安装+配置+环境创建教程_anaconda配置-CSDN博客

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📢📢📢这里介绍两种方法，我是用第二种方法安装成功的，如果想尝试第一种方法，可以自己尝试📢📢📢 

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✏️方法一：

这个方法是最简单的，但是经常网络会出现问题，导致下载不了很多依赖的包，或者其他一些问题。我用这个方法反反复复试了很多次👿，在我第一次安装的时候试了很多次，突然有一天就装好了，后面我把anaconda卸载重新安装，在用这个方法就没装上。大部分的问题是网络原因。

如果这种方法可以，适合自己的，那么安装Deeplabcut就很容易和方便。

Step 1 安装Anacoda，如果安装好了，直接跳过

 Step 2 下载deeplabcut，.yaml文件，所有的依赖项和包都在这个文件里可以下载

 直接下载 CONDA 文件 .yaml：点击下载.yaml（需要知道下载到哪个文件夹里）

 📁首先我们找到下载的文件夹，我这里下载的位置在G盘

 Step 3：然后打开安装好的anaconda3<anaconda prompt

  Step 4：出现下面这个终端命令框,输入G： 可以看到成功切换到G盘，这里根据自己的文件位置修改

🔔 确保你的终端包含.yaml文件的文件夹中（列如我下载的文件在G盘，终端的文件也是在G盘）

 Step 5：运行下面这段代码

conda env create -f DEEPLABCUT.yaml

终端会列出安装的包和依赖项，出现y/n时，输入y，再点击enter即可，等待安装。

Step 6：安装完成后，输入

python -m deeplabcut

如果到这里可以打开Deeplabcut的GUI界面，说明你真是一个幸运鹅🤣🤣🤣

🥹🥹🥹如果出现安装失败，也不用气馁，可能是网络原因，鼠标叉掉终端，在打开终端，输入下面这个命令，卸载刚刚安装的deeplabcut环境。

conda remove -n DEEPLABCUT --all

 可能存在的网络原因，我们可以试着关闭防火墙和关闭VPN和网络代理，再次按照上面的Step2-6尝试一下，如果还没有成功按照第二种方法基本都可以成功。

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✏️方法二：

🥹🥹🥹虽然我们不能通过第一种简单的方法安装成功，但是第二种方法也不是很复杂，只需要输入几行命令即可🥹🥹🥹跟着我step by step,肯定能安装成功。

Step 1：我们需要打开anaconda prompt的命令框，创建一个新的conda environment

     在终端输入

conda create -n deeplabcut python=3.10

 系统将提示您（y/n）安装，输入y,再按键盘的enter键，然后等待安装。最后，检查终端，输入：

conda activate deeplabcut

现在，我们将安装核心依赖项。它的工作方式是有“包管理器”，例如conda本身和 python的pip

Step 2：安装PyTorch（这里分为两个方向GPU和CPU）

 🔔🔔🔔如果你的电脑有GPU（没有GPU或者不想用GPU这步不用看），并且想用GPU进行训练，可以输入以下命令

适用于 CUDA 11.8 的 pytorch 的 GPU 版本（可以根据自己电脑的cuda进行修改）

conda install pytorch cudatoolkit=11.8 -c pytorch

🔔🔔🔔如果你的电脑只有CPU，输入以下命令

conda install pytorch cpuonly -c pytorch

Step 3：安装DeepLabCut

接下来，我们将安装Tables （也称为 pytables），这是一个用于读取构成 DeepLabCut 数据管理支柱的 HDF5 文件的包，输入

conda install -c conda-forge pytables==3.8.0

然后我们将安装所有deeplabcut源代码🔥输入

pip install "deeplabcut[gui,modelzoo,tf]"

到这里安装基本完成，安装过程中可能因为网络原因安装的比较慢，等待即可，最后我们输入以下命令，检查Deeplabcut是否成功安装。

python -m deeplabcut

🫡🫡🫡这种方法安装也不是很复杂嘛！！🫡🫡🫡

也有其他的方法，像git clone源代码或者Docker安装在本地的方法，可以自己探索哦，我这里安装成功可以用就行了😍😍😍，已满足。

🤭🤭🤭等我把这个软件探索好了，下一篇写一个Deeplabcut的使用教程🤭🤭🤭🤭

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以上方法安装的DLC版本是2.3.10，也就是稳定的版本，这里我自己更新到了DLC3.0.0rc1,最主要的区别就是可以切换训练引擎（pytorch/tensorflow）。

 🤗🤗🤗更新方法：直接打开anaconda prompt，切换到deeplabcut环境下🤗🤗🤗

然后输入以下代码

pip install deeplabcut==3.0.0rc1

等待安装即可

接着打开deeplabcut,可以看到DLC版本更新为3.0