生物信息
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黑脸少年
这个作者很懒,什么都没留下…
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find_circ详细使用指南
首先fine_circ是在py27运行,需要numpy和pysam这两个库,pysam不支持windows系统,所以建议在linux下运行。使用到软件VMWare,pycharm。1 pysam安装首先先尝试pip install pysam或者conda 指令,如果失败,在加上镜像文件试一次,如果还失败,请使用wheel文件安装。2 bowtie2和Samtools安装参考以下链接:科学网—Bowtie2和Samtools软件更新 - 卢锐的博文......原创 2022-06-21 15:51:02 · 518 阅读 · 0 评论 -
Pysam安装方法以及所有安装失败的库
pysam目前不支持windows系统,网上所谓的pysam-win,nrel-pysam我均尝试过。最后还是选择使用linux系统。在linux系统下的pycharm中直接pip install pysam也失败,第一次报错是超时,修改镜像为阿里云,下载成功但安装失败。第二次准备直接使用wheel安装,去相应网站下载对应版本的pysam.wheel,注意m和mu的区别。Python pysam项目安装包(第三方库)下载资源&安装指南页面 - PyPI - Python中文网...原创 2022-05-07 18:07:00 · 6204 阅读 · 2 评论 -
cygwin,cd-hit安装和使用
最近想使用cd-hit对RNA进行取冗余1 cygwin安装具体安装过程参考下面链接,不过要注意在安装组件包的时候记得安装make组件Windows:安装cygwin教程_Big_quant的博客-CSDN博客_cygwin目录目录前言常见错误前言本篇文章参考这篇: cygwin安装 但自从博主写后,这个东西发生了一些变化,因此,根据最新版的重新写了一遍。 我们可以到Cygwin的官方网站下载Cygwin的安装程序或者直接使用来下载安来下载安装程序.下载完成后,运行setup.exe程序,首先是原创 2022-05-01 16:55:40 · 1707 阅读 · 0 评论