** ERROR (nifti_image_write_hdr_img2): cannot open output file

于 2021-06-03 23:13:53 发布
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分类专栏： 预处理 SimpleITK 文章标签： python 图像处理
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SimpleITK保存时

out = sitk.GetImageFromArray(img_new)
sitk.WriteImage(out,r’E:\自己的文件名xxx’)##

运行代码报错
** ERROR (nifti_image_write_hdr_img2): cannot open output file ‘E:\自己的文件名xxx’

网上找了半天解决方法都没效果依旧报错，最后忽然！想起来sitk.WriteImage保存时路径不能有中文。

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SimpleITK写入数据
zhangjipinggom的博客
03-28 3308
1. 问题 如果直接用sitk.GetImageFromArray(),然后sitk.WriteImage(),会使得生成的数据spacing,Origin等属性都变成默认的，比如spacing会变成[1,1,1] # lost header, including spacing img_npy = sitk.GetArrayFromImage(img_sitk) new_img_npy = img_npy[z_begin: z_end, :, :] new_mask_npy = mask_npy[z_
** ERROR (nifti_image_write_hdr_img2): cannot open output file ‘fixed_lits/label\hepaticvessel_001.n
weixin_44919322的博客
10-01 319
解决方法：子目录不存在，写入的时候未自动创建这个子目录。
关于SimpleITK 使用函数sitk.WriteImage报错‘ERROR (nifti_image_write_hdr_img2): cannot open output file ‘
qq_36401512的博客
01-22 4908
报错** ERROR (nifti_image_write_hdr_img2): cannot open output file './result17/HGG/Brats17_CBICA_AXN_1.nii.gz' 1.首先判断路径是否存在，发现没问题。 2.其次查看磁盘空间是否不足，发现已经不够用了。
cannot open preprocessing output output file "main.d"
行者
06-25 2731
参考：http://jaysheng702.blog.163.com/blog/static/17587874720132735416494/
NIfTI_20140122.zip_matlab 打开 nii_nii 图像_twentyb4v
07-15
在IT领域，尤其是在生物医学影像分析中，NIfTI（Neuroimaging Informatics Technology Initiative）格式是一种广泛使用的文件格式，用于存储和分享脑成像数据。标题中的"NIfTI_20140122.zip_matlab 打开 nii_nii ...
NIfTI_20140122.zip_MATLAB nii读取及显示_nii文件_加载nii
09-23
标题 "NIfTI_20140122.zip" 涉及的是一个关于MATLAB处理NIfTI(nifti-1)文件的教程，重点在于如何在MATLAB环境中读取和显示这种格式的神经影像数据。NIfTI（Neuroimaging Informatics Technology Initiative）是一种...
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07-15
这个Matlab程序包用于处理核磁共振图像，可以读取显示、保存、制作该图像。
NIfTI_20140122.rar
02-23
NIfTI（Neuroimaging Informatics Technology Initiative）是一种用于存储和交换神经影像数据的文件格式，广泛应用于医学成像领域，尤其是脑成像研究。20140122版的NIfTI文件可能包含了该时期的更新或特定的研究数据...
niftilib:**现在主要站点：https://github.com/NIFTI-Imaging/nifti_clib **-开源
04-29
niftilib是用于nifti1神经图像数据格式的I / O例程的集合。 可以使用C（nifticlib），Java（niftijlib），Matlab（niftimatlib）和Python（pynifti）代码。 有关nifti格式的信息，请参见：...
如何读取NIFTI格式图像（.nii文件）
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在医学图像处理中，我们经常使用一种NIFTI格式图像（.nii文件），现在我们来看看 什么是.nii文件？ 该如何读取.nii文件？ 1. NIFTI格式图像 什么是NIFTI（Neuroimaging Informatics Technology Initiative）格式图像？ 在讲解什么是NIFTI格式之前，得先了解一下 Analyze格式。Analyze格式储存的每组数据组包含2个...
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08-24 6980
  #SimpleITK在dcm图像的应用 import SimpleITK as sitk import numpy as np dcm_file = 'dir_path/test.dcm'   #获取图像的tag信息 image = sitk.ReadImage(dcm_file) keys = image.GetMetaDataKeys() for key in keys:   ...
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最近读了一篇论文[1]，是利用深度学习进行MRI图像重建的，作者在github[2]上提供给我们的他的实现代码，他使用的一个MRI分割比赛的数据集[3]，但是将数据集下载下来发现全部都是.nii格式的文件，用普通的方法也是打不开的，经过一个星期的摸索，也是大概了解了如何读取以及处理.nii文件。 1. NIFTI出现原因 .nii文件是NIFTI格式的文件，出现的原因是原来一种图像格...
C++编译之提示ld: can‘t open output file for writing: test1, errno=21 for architecture x86_64
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1 问题 在mac 终端写了一个cpp文件，然后用命令编译运行提示错误如下 1111deMBP:code a1111$ g++ -std=c++11 test1.cpp -o test1 ld: can't open output file for writing: test1, errno=21 for architecture x86_64 clang: error: linker co...
医学图像的.img/.hdr格式导出.jpg格式
weixin_40871749的博客
12-01 3922
最近在公司上手利用深度学习识别医学图像，但苦于医学图像的各种格式的转换问题，所以在此写写自己的转格式的经历：   ----------------------------------- 首先，我拿到的是.img/.hdr。并且是个3维数据，需要切片，并且转为.jpg才好放进网络中。   ---------------------------------- 第一步：转为.dcm格式。 ...
AttributeError: 'Nifti1Image' object has no attribute 'numpy'
最新发布
03-16
这个错误是因为`Nifti1Image`对象没有`numpy`属性。你可能需要将`Nifti1Image`对象转换为`numpy`数组，可以使用`get_fdata()`方法来实现。示例如下： ```python import nibabel as nib # 加载Nifti1Image对象 nifti_image = nib.load('your_nifti_file.nii') # 将Nifti1Image对象转换为numpy数组 numpy_array = nifti_image.get_fdata() ```
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