编程作业（2） - 2021 编程题 10. DNA序列（Java）

【问题描述】 

一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例（定义为GC-Ratio）是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目（也就是序列长度）。在基因工程中，这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。

给定一个很长的DNA序列，以及要求的最小子序列长度，研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。

【输入形式】输入一个string型基因序列，和int型子串的长度

 

【输出形式】找出GC比例最高的子串,如果有多个输出第一个的子串

【样例输入】AACTGTGCACGACCTGA 5

【样例输出】GCACG

import java.util.Scanner;

public class Main {
	
	public static void main(String[] args) {
		Scanner s = new Scanner(System.in);
		String str=s.next();
		int n=s.nextInt();
		int count=0,index=0;
		for(int i=0;i<=str.length()-n;i++){
			String temp=str.substring(i,i+n);
			int num=0;
			for(int j=0;j<n;j++){
				if(temp.charAt(j)=='C'||temp.charAt(j)=='G'){
					num++;
				}
			}
			if(num>count){
				count=num;
				index=i;
			}
		}
		System.out.println(str.substring(index,index+n));
		
		
		s.close();
	}
	
}