R装包出现 Building R package and error “ld: cannot find -lgfortran“

首先我用的是mac OS

参考网址
https://stackoverflow.com/questions/6302209/building-r-package-and-error-ld-cannot-find-lgfortran

首先安装gcc
当我输入brew install gcc之后，发现有错误

解决办法
brew update
结果如下
然后重新安装gcc
brew install gcc
结果如下
注意这里我的gcc版本是12.2.0
打开Rstudio,输入
usethis::edit_r_makevars()

VER=-12
CC=gcc$(VER)
CXX=g++$(VER)
CFLAGS=-mtune=native -g -O2 -Wall -pedantic -Wconversion
CXXFLAGS=-mtune=native -g -O2 -Wall -pedantic -Wconversion
FLIBS=-L/usr/local/Cellar/gcc/12.2.0/lib/gcc/12

关闭保存就可以了

测试
devtools::install_github('YingMa0107/CARD')

今天mac(M1)重新安装了lisi包时，发现还是存在这个问题

devtools::install_github("immunogenomics/lisi")

结果如下

但是这里存在一个问题，就是gcc的问题

这里其实是这样的，当你安装完xcode之后，可以看到

但是进行

brew install gcc

这里显示的gcc的版本是


这里的gcc位置是

/opt/homebrew/Cellar/gcc/13.2.0

相当于新产生了一个gcc,这个版本和之前是不一样的，而且这个位置和
之前的不一样，之前的位置是/usr/local, 现在这个位置是\opt\homebrew

然后实行

usethis::edit_r_makevars()

修改markvars文件内容如下

VER=-13
CC=gcc$(VER)
CXX=g++$(VER)
CFLAGS=-mtune=native -g -O2 -Wall -pedantic -Wconversion
CXXFLAGS=-mtune=native -g -O2 -Wall -pedantic -Wconversion
FLIBS=-L/opt/homebrew/Cellar/gcc/13.2.0/lib/gcc/13

然后重新安装lisi包