图像处理(ITK)
ITK图像(用于医学图像处理和分析)
1.itkimg.GetSpacing()
用于获取ITK图像对象的像素间距方法,在医学图像中,像素间距指的是图像中相邻像素之间的物理距离。这个距离通常以三个数值表示,即像素间在 x、y 和 z 方向上的距离。调用这个方法将返回一个包含像素间距的元组或数组,具体取决于 ITK 图像对象的实现。
2.sitk.GetImageFromArray,SetSpacing
ITKPred = sitk.GetImageFromArray(pred, isVector=False)
ITKPred.SetSpacing(spacing)
ITKTrue = sitk.GetImageFromArray(groundtruth, isVector=False)
ITKTrue.SetSpacing(spacing)
sitk.GetImageFromArray()将pre数组转换为ITK图像对象,isVector=False参数表示输入数组不是矢量(多通道)图像。通过ITKPred.SetSpacing(spacing)来设置图像对象的像素间距。spacing是一个表示像素间距的元组或数组,包含在spacing变量中。通过设置像素间距,可以确保图像在物理空间中的坐标和距离的准确性。
通过将NumPy数组转换为ITK图像对象,并设置像素间距,就可以在ITK中进行进一步的图像处理和分析
2.sitk.LabelOverlapMeasuresImageFilter();sitk.HausdorffDistanceImageFilter()
overlap_measures_filter = sitk.LabelOverlapMeasuresImageFilter()
hausdorff_distance_filter = sitk.HausdorffDistanceImageFilter()
- sitk.LabelOverlapMeasuresImageFilter()是用于计算标签图像之间重叠度量的滤波器。这个滤波器可以用于评估标签图像之间的相似性、重叠和一致性。在应用滤波器之前,需要将标签图像设置为输入,并通过滤波器的方法获取各种重叠度量,如Dice系数、Jaccard系数、体积差异等。
- sitk.HausdorffDistanceImageFilter()是用于计算标签图像之间的Hausdorff距离的滤波器。Hausdorff距离是衡量两个标签图像之间的最大距离的度量。该滤波器将标签图像作为输入,并通过滤波器的方法获取Hausdorff距离以及与之相关的度量,如平均Hausdorff距离等。
两个滤波器通常用于评估分割算法的性能,特别是在医学图像分割领域。它们提供了一种方便的方式来计算不同标签图像之间的重叠和距离度量,以评估分割结果与参考标准之间的一致性和准确性。