传染病学模型 | Python实现基于SEIR传染病模型和MCMC马尔可夫链蒙特卡洛算法的疫苗接种场景模拟

最新推荐文章于 2024-02-19 14:29:39 发布
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分类专栏： 传染病学模型(Epidemic Models) 文章标签： SEIR MCMC 马尔可夫链蒙特卡洛算法
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马尔可夫模型 | Python实现基于SEIR传染病模型和MCMC马尔可夫链蒙特卡洛算法的疫苗接种场景模拟
算法如诗的博客
07-23 203
马尔可夫模型 | Python实现基于SEIR传染病模型和MCMC马尔可夫链蒙特卡洛算法的疫苗接种场景模拟
MCMC_传染病模型matlab_SEIR模型改进_SEIR_
09-30
使用seir及其改进模型估计传染病的参数
经典的传染病模型简介 + SIS情况分析
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Ray的博客
01-30 2万+
传染病模型简介 + SIS情况分析简介各类经典传染病模型（基础形式）SIS模型假设符号说明微分方程组模型结论经典传染病模型的缺陷 简介 研究传染病模型，对社会经济和维持秩序有重大意义，尤其在过去的2020年，新冠疫情爆发。从数学领域对疫情进行分析，根据经典的传染病模型，考虑新的因素，加入新的变量，也是疫情追踪和防控的一种有力手段。 最近刚好有机会用到传染病模型，趁此机会先对其有一个大致的了解。 常见的传染病模型按照具体的传染病的特点可分为 SI、SIS、SIR、SIRS、SEIR 模型。其中“S”、“E”、
交互媒体专题设计大作业——瘟疫模拟：群体建模专题设计（第一阶段）
Arzeus的博客
04-27 819
瘟疫模拟：群体建模专题设计（第一阶段） 背景 方案设计 作品方向 基于processing对瘟疫进行简单模拟，模拟的情景封闭学校在疫情发生期间，没有进行管控的发展形势。学生随机游荡在教室，食堂，宿舍，所有学生分为5种类型，健康，潜伏无传染性，潜伏有传染性，患病，康复。大体设计方向类似下图： 主要模拟以细胞自动机（生命游戏）为基础，借以SEIR模型进行改进。 资料调研——SEIR模型 SI模型 ...
建立流行病预警指数体系并优化传染病模型：对公共卫生突发事件监测数据的分析
myboyliu2007的专栏
02-19 1071
R ，从传染病模型中移除的人群，指的是被隔离或对该疾病具有免疫力的人群[59]。经过数据筛选、分类和其他预处理工作，结合各国数据趋势，从2020年1月16日至5月15日中国累计确诊病例、累计疑似病例、新增确诊病例、累计死亡病例和累计治愈病例，以及从2020年2月1日至4月30日日本、韩国和英国（英国）的累计确诊病例和累计疑似病例，最终保留了从2020年3月1日至5月29日美国（美国）的新确诊病例、累计死亡病例和累计治愈病例，使用每个国家90天的新冠疫情相关数据集作为训练样本集，以确诊病例的时间数据集。
马尔可夫链蒙特卡罗算法
weixin_30919235的博客
10-16 170
抽样算法的主要任务是找到符合给定分布的一系列样本。对于简单的分布，可以通过基本的抽样算法进行抽样。大多数分布都是不容易直接抽样的，马尔可夫链蒙特卡罗算法解决了不能通过简单抽样算法进行抽样的问题，是一种重要的实用性很强的抽样算法。 马尔可夫链蒙特卡罗算法（简写为MCMC）的核心思想是找到某个状态空间的马尔可夫链，使得该马尔可夫链的稳定分布就是我们的目标分布。这样我们在该状态空间进行随机游走的时候，...
马尔可夫链
StuTan
08-14 1046
马尔可夫链 简单介绍 马尔可夫链是一个经典算法，马尔可夫链（Markov chain），又称离散时间马尔可夫链（discrete-time Markov chain），因俄国数学家安德烈·马尔可夫（俄语：Андрей Андреевич Марков）得名，为状态空间中经过从一个状态到另一个状态的转换的随机过程。该过程要求具备“无记忆”的性质：下一状态的概率分布只能由当前状态决定，在时间序列中它前...
python蒙特卡洛模拟_用Python实现蒙特卡洛模拟
weixin_39955925的博客
12-08 4751
引用Numpy库NumPy库是Python的一种开源的数值计算扩展，提供了许多高级的数值编程工具，如：矩阵数据类型、矢量处理，以及精密的运算库。NASA用其来处理一些运算。蒙特卡洛模型用到的Numpy句法：1、首先引用Numpy库，起个名字叫npimport numpy as np2、生成符合正太分布的0~99之间的随机整数 ，total_count代表生成随机数的个数，也就是要模拟多少次np.r...
蒙特卡洛方法：Python实现
weixin_39753819的博客
01-23 2120
上期已介绍了蒙特卡洛方法，在这篇博客中，将使用Python实现蒙特卡洛算法，并逐步解释代码的作用。蒙特卡洛算法的一个经典应用是估算圆周率 π 的值。将通过在单位正方形内随机生成点，并统计落在单位圆内的点的比例来估算 π。
蒙特卡洛方法以及python实现
catkin_ws的博客
05-20 4298
这里写自定义目录标题什么是蒙特卡洛方法(Monte Carlo method)蒙特卡洛方法的基本思想蒙特卡洛求定积分蒙特卡洛方法python实例如何改变文本的样式插入链接与图片如何插入一段漂亮的代码片生成一个适合你的列表创建一个表格设定内容居中、居左、居右SmartyPants创建一个自定义列表如何创建一个注脚注释也是必不可少的KaTeX数学公式新的甘特图功能，丰富你的文章UML 图表FLowch...
基于SEIR传染病模型和MCMC马尔可夫链蒙特卡洛算法的疫苗接种场景模拟（Python完整源码）
07-23
基于SEIR传染病模型和MCMC马尔可夫链蒙特卡洛算法的疫苗接种场景模拟（Python完整源码） 基于SEIR传染病模型和MCMC马尔可夫链蒙特卡洛算法的疫苗接种场景模拟（Python完整源码） 基于SEIR传染病模型和MCMC马尔可夫链...
基于传染病动力学模型SEIR和LSTM神经网络实现新型冠状病毒肺炎预测python源码+详细注释+项目说明.zip
01-11
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传染病SEIR传播动力模型python代码
04-17
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Matlab传染病学模型(Epidemic Models：SI, SIS, SIR, SIRS, SEIR, SEIRS)
09-26
Matlab传染病学模型(Epidemic Models：SI, SIS, SIR, SIRS, SEIR, SEIRS) Matlab传染病学模型(Epidemic Models)
蒙特卡洛仿真的基于Python实例
王斯的博客
12-04 2387
文章原作者：新缸中之脑 文章链接：https://www.toutiao.com/i7028498316396839432/?tt_from=weixin&utm_campaign=client_share&wxshare_count=1&timestamp=1638613017&app=news_article&utm_source=weixin&utm_medium=toutiao_ios&use_new_style=1&req_id=2.
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maven下载安装包全套软件安装
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06-01
好的，我们可以通过最小二乘法对传染病模型的未知参数进行估计。以下是一个基于SIR模型的matlab代码，用来模拟传染病的传播过程和对参数的估计。 首先，我们需要定义SIR模型： $$\frac{dS}{dt}=-\frac{\beta SI}{N}$$ $$\frac{dI}{dt}=\frac{\beta SI}{N}-\gamma I$$ $$\frac{dR}{dt}=\gamma I$$ 其中，S表示易感人群，I表示感染人群，R表示康复人群，N表示总人口数，$\beta$表示感染率，$\gamma$表示康复率。 然后，我们可以用matlab编写相应的代码来模拟传染病的传播过程和对参数的估计： ```matlab % 定义模型参数 N = 1000000; % 总人口数 beta = 0.8; % 感染率 gamma = 0.2; % 康复率 tspan = [0 365];% 模拟时间范围 % 初始条件 I0 = 1; % 初始感染人数 R0 = 0; % 初始康复人数 S0 = N - I0 - R0;% 初始易感人数 y0 = [S0 I0 R0]; % 初始状态 % 定义ODE函数 odefun = @(t,y) [-beta*y(1)*y(2)/N; beta*y(1)*y(2)/N-gamma*y(2); gamma*y(2)]; % 解ODE方程 [t,y] = ode45(odefun,tspan,y0); % 绘制感染人数随时间的变化曲线 plot(t,y(:,2),'r','linewidth',2); xlabel('时间'); ylabel('感染人数'); % 最小二乘法估计参数 fun = @(x) sum((y(:,2)-x(1)*y(:,1).*y(:,2)/N).^2); % 定义目标函数 x0 = [1]; % 初始猜测值 x = fminsearch(fun,x0); % 最小化目标函数，得到参数估计值 % 输出参数估计值 disp(['估计的感染率beta：',num2str(x)]); ``` 在这个模型中，我们同样假设初始时只有1个人感染了病毒，其余人均为易感人群，然后我们用ode45函数求解ODE方程，得到在一年内感染人数的变化情况。最后，我们用最小二乘法估计感染率$\beta$的值，并输出估计结果。 当然，这只是一个简单的模型，实际上还需要考虑很多其他因素，比如隔离措施、疫苗接种等。如果您需要更加复杂的模型，可以告诉我。

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