数据特征降维 | 多维缩放(MDS)附Python代码

多维缩放(Multidimensional Scaling,MDS)是一种经典的降维和可视化技术,用于将高维数据映射到低维空间中,以便更好地展示数据的相似性和差异性。

MDS的基本思想是通过测量样本之间的距离或相似性,将其映射到低维空间中,使得在低维空间中的距离能够保持或近似原始高维空间中的距离。通过这种方式,MDS可以展示数据样本之间的关系和结构,并提供直观的可视化结果。

以下是MDS的基本步骤:

计算距离或相似性:对于高维数据中的每对样本,计算它们之间的距离或相似性。距离可以使用欧氏距离、相关系数、余弦相似性等进行度量。
构建距离矩阵:根据计算得到的距离或相似性,构建一个距离矩阵或相似性矩阵,其中每个元素表示样本之间的距离或相似性度量。
计算低维表示:通过对距离矩阵进行降维,得到样本在低维空间中的表示。常用的降维方法包括经典MDS(Classical MDS)、度量MDS(Metric MDS)和非度量MDS(Non-metric MDS)等。
可视化和解释:将降维后的低维表示进行可视化,以展示数据的结构和关系。在低维空间中,样本之间的距离或相似性反映了它们在高维空间中的关系。
MDS的目标是在低维空间中保持或近似高维空间中样本之间的关系,以尽可能准确地反映原始数据的结构。MDS方法的选择和参数设置会对结果产生影响,因此需要根据具体情况选择合适的MDS变体和参数。

原理:MDS试图在低维空间中保持样本间的距离,使得这些距离尽可能接近它们在原始高维空间中的距离。

应用:常用于探索性数据分析和可视化,尤其是在样本间距离的保持是重要的场景中。

from sklearn.manifo

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