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生物信息学
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主要研究对基因组学进行数据挖掘,它涉及到基因组的结构,功能,表达,进化和疾病相关性等方面。对基因组学的大量的基因数据进行数据挖掘分析。
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生信&数据挖掘——人工神经网络篇(3)差异分析
在这篇文章中,我将讨论如何使用基因表达差异分析(DEA)来进行差异分析。DEA是一种有效的方法,可以从大量基因表达数据中检测和预测差异。我将介绍DEA的基本原理,并讨论如何使用它来进行差异分析。我还将介绍一些常用的DEA技术,以及它们如何用于差异分析。最后,我将介绍一些实际应用,以及如何使用DEA来解决实际问题。原创 2023-01-20 20:53:31 · 4016 阅读 · 2 评论 -
生信&数据挖掘——人工神经网络篇(2)GEO数据下载及注释
基因组学是一门研究基因组的科学,它涉及到基因组的结构,功能,表达,进化和疾病相关性等方面。基因组学的研究需要大量的基因数据,而这些数据可以从公共数据库中获得。其中最常用的数据库是GEO(Gene Expression Omnibus),它提供了大量的基因表达数据,可以用于基因组学研究。GEO数据库中的数据可以通过FTP或Web界面下载,下载的数据可以是原始数据,也可以是已经注释的数据。。原创 2023-01-20 17:24:21 · 5214 阅读 · 0 评论 -
生信&数据挖掘——人工神经网络篇(1)软件准备
人工神经网络(ANN),这是一种基于模拟生物神经网络的计算机模型,它可以用来解决复杂的问题,如识别图像、语音识别、自然语言处理等。ANN可以模拟人类大脑的学习和记忆过程,它可以从大量的数据中学习,并从中提取出有用的信息。它可以自动识别模式,并从中提取出有用的信息,从而提高数据挖掘的效率。ANN的应用非常广泛,它可以用来解决复杂的问题,如自动驾驶、机器人控制、智能家居等。博主我相信,ANN将会成为未来数据挖掘的重要工具,它将为我们提供更多的机会,让我们可以更好地利用数据,更好地服务于社会。原创 2023-01-20 16:29:43 · 2141 阅读 · 0 评论 -
数据挖掘 and 生物信息学之旅
🎇我的生物信息学之旅始于一位导师的指引。在这之前,我对这门学科抱有很大的偏见,认为实验生物学才是正统,而生物信息学只是不正统的“非主流”。但是,随着我深入学习这门课程,我发现了它的魅力所在。基于各种算法预测和分析,找出我们想要的信息是一种非常有趣的体验。我希望大家不要因为自己的偏见而错过这样一个好机会,学习生物信息学是一件非常有意思的事情。原创 2023-01-20 13:09:55 · 1208 阅读 · 0 评论 -
傻瓜式快速下载TCGA数据(win x86版本)
1)Exploration:在页面右边勾选自己想要的数据,然后点击 view Files in Repository,跳转到Repository页面进一步筛选.建议大家先从Exploration页面筛选数据再到Repository页面筛选,最后下载Manifest文件。2、下载好的Manifest 打开软件傻瓜操作快速下载数据。1、GDC筛选检索下载需要数据的Manifest文件。速度比官网下载快了不知道几倍(之前下了2个小时)3)体验速度(一分钟下载完100m文件)............原创 2022-08-16 15:14:44 · 966 阅读 · 8 评论