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RSS订阅原创 安装ArchR包出现的报错
这行代码再运行即可安装。将禁用构建工具的检查，这意味着在尝试安装包时将不再执行编译工具的检查。虽然这可以让你继续安装包，但是在没有正确的编译工具链的情况下，可能会导致安装失败或者出现其他不可预料的问题。所以如果不是实在没办法的情况最好不要使用这个方法。在运行上面面R命令出现报错 显示无法安装。在GitHub上找到解决方法，输入。
2024-05-06 17:10:13
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原创 NCBI使用prefetch下载以及使用fastq-dump将.sra转fastq时遇到的CA证书验证失败的问题
使用fastq-dump，fasterq-dump还有parallel-fastq-dump都遇到了下面报错（因为这三个都是依赖ncbi的sra-tools，fastq-dump不行其他两个估计也不行），和前面的报错差不多。后面阴差阳错卸载了一次之后我才注意到我的sratoolkit版本是3.0.7，而根据报错里面的prefetch和fastq-dump的版本是2.8.0的，所以问题就出在这里。但是在用wget下载后生成的.sra文件是要我们转成.fastq文件的，在转换文件的时候问题又来了。
2024-04-15 19:16:07
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原创 linux中singularity挂载遇到的问题
singularity shell --bind /public/workspace/lincs/lab7/singlecell/cellranger/:自己的目录 cellranger7.1.0_py3_r4_latest.sif。文件和索引在不cp或者link过来的情况下，需要把自己目录挂载到老师目录下就可以使用，原因是没有把sif文件拷贝到自己目录下，自然没法找到，如果不想拷贝就输入绝对路径也可以。按照上面运行了以后发现找不到sif文件，然后重新使用绝对路径运行就可以了。
2024-03-06 17:00:38
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空空如也
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