linux中singularity挂载遇到的问题

文件和索引在不cp或者link过来的情况下,需要把自己目录挂载到老师目录下就可以使用,

sif运行的话,需要用bind参数加载ref

singularity shell --bind /public/workspace/lincs/lab7/singlecell/cellranger/:自己的目录 cellranger7.1.0_py3_r4_latest.sif

按照上面运行了以后发现找不到sif文件,然后重新使用绝对路径运行就可以了

原因是没有把sif文件拷贝到自己目录下,自然没法找到,如果不想拷贝就输入绝对路径也可以

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