R语言相关性分析

最新推荐文章于 2024-08-08 16:02:03 发布
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分类专栏： R语言 文章标签： R语言 相关性分析 皮尔逊 偏相关 协方差
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相关性分析就是通过定量指标描述变量之间的强弱、直接或间接的联系。

常见相关性指标

  • Pearson相关系数(积差相关系数)
  • Spearman等级相关系数
  • Kendall’s Tau相关系数
  • 偏相关

Pearson相关系数(积差相关系数)

Pearson相关系数是用于表示相关性大小的最常用指标，数值介于-1~1之间，越接近0相关性越低，越接近-1或1相关性越高。正负号表明相关方向，正号为正相关、负号为负相关。

适用条件

  • 两个正态分布的连续变量

Spearman等级相关系数

又称为秩相关系数，利用两变量的秩次大小来进行分析，属于非参数统计方法。

适用条件

  • 适用于不满足Pearson相关系数正态分布要求的连续变量。
  • 也可以用于有序分类变量的之间的相关性测量。

Kendall’s Tau相关系数

Kendall’s Tau相关系数是一种非参数检验。

适用条件

  • 适用于两个有序分类变量。

偏相关

当要进行相关性分析的两个变量其取值受到其他变量影响时，可以利用偏相关分析对其他变量进行控制，在控制其他变量基础之上进行这两个变量之间相关性分析。

适用条件

  • 考虑第三方影响的两个变量之
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使用R进行相关性分析
weixin_30408309的博客
09-09 6708
基于R进行相关性分析 一、相关性矩阵计算： [1] 加载数据： 　　>data = read.csv("231-6057_2016-04-05-ZX_WD_2.csv",header=FALSE) 说明：csv格式的数据，header=FALSE 表示没有标题，即数据从第一行开始。 [2] 查看导入数据的前几行， >head(data) 　　 [3] 删...
r语言相关性分析_R语言 | 相关性分析与酷炫图（代码+讲解）
weixin_39646107的博客
12-08 1万+
大家好，我是菜鸟君。最近在B站后台和QQ群被小伙伴们催到崩溃。感谢各位的鞭笞，不是，充满爱意的提醒。今天就来说说R语言怎么进行相关性分析。首先，安装两个R包，其中“corrplot”包就能画出好多酷炫的相关性矩阵图。“pheatmap”包是用来画热力图的。install.packages("corrplot")install.packages("pheatmap")library("ph...
R 相关与相关性的显著性检验
daisy的博客
04-11 5万+
1.数据说明R语言的自带的数据包中states.x77（关于美国50个州的某些数据）第1至6列的50份数据从统计的角度以及R语言的角度进行分析，看看R语言是怎么做相关分析的，同时怎么看分析出的结果 首先我们观察一下states.x77中第1至6列的数据及其意义列名解释单位Population人口人Income人均收入美元/人Illiteracy文盲率%Life Exp预期寿命年Murder谋杀率%...
R 语言入门 —— 基础语法
dxs18459111694的博客
06-14 966
R是一种用于统计分析、图形展示和报告的编程语言。由Ross Ihaka和在1990年代早期在新西兰奥克兰大学开发，设计之初就作为统计数据分析和图形表示的工具。R语言的灵感来自于S语言，后者是在贝尔实验室开发的一种先进的统计编程语言。R继承了S语言的多种特性，并且以其开源的特点，在全球范围内迅速获得了广泛的应用和发展。函数是具有特定功能的代码块，我们通过将完成某一功能，或需要重复执行的代码封装起来，并为这些代码取一个函数名，函数包含函数名、输入参数、函数体以及返回值。R中的函数可以显式的使用return。
相关性分析(R语言rcorr）
最新发布
rongrongnancy的博客
08-08 424
适合初学者的简单R代码相关性系数和显著性P值计算及可视化绘图
R语言分析相关性
qq_27390023的博客
04-04 2329
1. 相关性 x <- iris cov(x$Sepal.Length,x$Petal.Length) cor(x$Sepal.Length,x$Petal.Length) cor(x$Sepal.Length,x$Petal.Length,method = "kendall") cor(x$Sepal.Length,x$Petal.Length,method = "spearman") #cor函数可计算三种相关性系数：pearson,kendall和spearman,默认是pearso
r语言相关性分析
YNingG的博客
05-19 1020
install.packages("corrplot") install.packages("pheatmap") library("corrplot") library("pheatmap") x = cPriceData summary(x) dim(x) #列与列之间的协方差 cov(x) pheatmap::pheatmap(cov(x)) #列之间的相关性系数 cor(x) pheatmap::pheatmap(cor(x)) corrplot(cor(x), type = "uppe
相关性分析 | R语言 -- 两个变量的相关性分析
康娜的博客
09-15 3313
相关检验用于评估两个或多个变量之间的关联。例如，如果我们想知道父亲和儿子的身高之间是否存在关系，可以计算相关系数来回答这个问题。如果两个变量（父亲和儿子的身高）之间没有关系，则儿子的平均身高应该相同，而与父亲的身高无关，反之亦然。在这里，我们将描述不同的相关方法，并使用R软件提供一些实用的示例。
【R统计】R语言相关性分析及其可视化
R酷的数据科学笔记
02-26 6664
R语言相关性分析，解决不等长矩阵的相关性分析，值得学习和收藏~
R语言相关性
01-07
R语言相关性 相关系数可以用来描述定量变量之间的关系。相关系数的符号（±）表明关系的方向（正相 关或负相关），其值的大小表示关系的强弱程度（完全不相关时为0，完全相关时为1）。 1、相关的类型 1、Pearson、Spearman和Kendall相关 Pearson积差相关系数衡量了两个定量变量之间的线性相关程度。 Spearman等级相关系数则衡量分级定序变量之间的相关程度。 Kendall’s Tau相关系数也是一种非参数的等级相关度量。 cor()函数可以计算这三种相关系数，而cov()函数可以用于计算协方差，两个函数的参数有 很多，其中与相关系数的计算有关的参数可以简化为：cor(x,
r语言相关性分析_R语言数据分析系列相关性
m0_46047369的博客
12-19 4521
以上只是提到如何进行其中两种基因的相关性分析，但如果我们想探索PTEN与其他基因之间的相关性分析，就要改代码进行进一步的计算，我们想到，R语言中可以进行循环计算。如果我们对其中某两个变量的相关性感兴趣，就可以利用先前讲到的ggplot2，如果我们想探索所有基因的相关性，那我们就可以利用corrplot或者PerformanceAnalytics了。上图中，我们可以看到两种基因的表达情况之间的相关性，随着PTEN的表达升高，Gli的表达也同样呈上升趋势，因此两者具有正相关性。这样的图形可能会更加美观一点。
【R语言】——相关性分析和热图绘制
weixin_54004950的博客
12-12 3万+
一、什么是相关性分析？相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析，从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性的元素之间需要存在一定的联系或者概率才可以进行相关性分析。在组学测序（如转录组）中需设置多个生物学重复，而对多个生物学重复样本的相关性分析，可从中判断生物学重复样本数据是否可以用于接下来的分析。如有一生物学重复不一致的情况，可去除变异数据，预防某一重复数据不可用，进而影响实验数据的分析。常见的相关性分析方法有三种：皮尔森（pearson。
r语言相关性分析_R语言相关性分析
weixin_39853590的博客
12-08 7850
内容目录Pearson相关系数(积差相关系数)适用条件Spearman等级相关系数适用条件Kendall's Tau相关系数适用条件偏相关适用条件R语言实现Pearson、Spearman、Kendall示例偏相关相关性显著性检验相关性可视化相关性分析就是通过定量指标描述变量之间的强弱、直接或间接的联系。常见相关性指标Pearson相关系数(积差相关系数)Spearman等级相关系数Ke...
R语言相关分析
qq_33683364的博客
01-03 2万+
相关分析相关系数可以用来描述定量变量之间的关系。相关系数的符号（±）表明关系的方向（正相关或负相关），其值的大小表示关系的强弱程度（完全不相关时为0，完全相关时为1）。我们将关注多种相关系数和相关性的显著性检验。我们将使用R基础安装中的state.x77数据集，它提供了美国50个州在1977年的Population(人口)、Income(收入)、Illiteracy(文盲率)、LifeExp(预期寿
r语言c5.0变量相关性,R语言之相关性分析(示例代码)
weixin_34086545的博客
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两个变量或两组变量之间的联系，对于连续变量称为相关性，对于分类变量称为关联性。一、连续变量间的相关性常用命令及选项如下使用方法如下：1.计算相关系数及相关系数矩阵> cor(count,speed)[1] 0.7237206> cor(count,speed,method = "spearman")[1] 0.5269556> cor(mf)Length Speed...
R语言数据相关性分析（相关系数和p值）及可视化
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此篇为转载R语言学习笔记之相关性矩阵分析及其可视化 数据相关性分析及可视化1. 新建数据集2. Hmisc3. 可视化相关系数矩阵4. chart.Correlation()来自于包PerformanceAnalytics5. 此篇为笔记转载如有侵权联系删除 1. 新建数据集 data(mtcars)#加载数据集 mydata <- mtcars[, c(1,3,4,5,6,7)] head(mydata, 6)#查看数据前6行 2. Hmisc 包里的rcorr()函数能够同时给出相关系数以及
R语言基础——简单相关性分析(1)
卫博
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r语言相关性分析作图
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R语言是一种广泛应用于统计计算、数据可视化以及数据分析的开源编程语言。进行相关性分析并制作图形图表，在R中是一个常见的任务，特别是在探索性数据分析（EDA）阶段，用于理解变量之间的关系。 ### R语言进行相关性分析的基本步骤： #### 1. 数据加载与准备 首先，需要将数据导入到R环境中。这通常通过`read.csv()`、`read.table()`或其他读取函数完成，取决于数据文件的格式。接着，检查数据集以了解其结构，包括观察的数量和每个变量的类型。 ```r # 加载数据 data <- read.csv("path_to_your_data.csv") # 检查数据框架的前几行和结构 head(data) str(data) ``` #### 2. 计算相关系数矩阵 使用`cor()`函数可以计算所有数值型列之间（如数值型变量与数值型变量）的相关系数。结果会是一个矩阵，显示了每对变量的相关系数。 ```r # 计算相关系数矩阵 cor_matrix <- cor(data[, sapply(data, is.numeric)]) # 查看相关系数矩阵 print(cor_matrix) ``` #### 3. 可视化相关性 最常用的可视化工具之一是散点图矩阵（pairs()），它能够直观地展示数据集中所有数值型变量之间的两两相关性。另外，热力图也是一个强大的视觉工具，用于表示相关性矩阵的颜色编码版本。 ```r # 散点图矩阵（适用于小数据集） pairs(data[, sapply(data, is.numeric)], pch = 19) # 热力图 library(ggplot2) library(reshape2) # 或者使用tidyverse包中的gather() # 将cor_matrix转换为长格式以便绘图 corr_long <- melt(cor_matrix) # 使用ggplot绘制热力图 ggplot(corr_long, aes(x=Var1, y=reorder(Var2, value), fill=value)) + geom_tile() + scale_fill_gradient2(low="blue", mid="white", high="red", midpoint=0) + theme_minimal() ``` ### 相关问题: 1. **如何解释相关性分析的结果**? - 解释相关系数的大小及其正负值，可以帮助理解两个变量间的关系强度和方向。 2. **在进行相关性分析之前需要注意哪些事项**? - 需要检查数据是否存在缺失值，并处理异常值或极端值；同时考虑数据的分布特性，如是否满足正态分布。 3. **有哪些高级的数据可视化库可用于R进行更复杂的相关性分析**? - `ggplot2`, `lattice`, 和 `plotly` 提供了丰富的定制选项和交互式功能，适合创建更复杂和美观的可视化图表。
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