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原创 RNA-Seq下机分析的一般流程

一些日常任务的脚本分享,批量处理RNA-Seq样本

2023-06-20 16:05:16 1534 1

原创 python3学习笔记(一):python3.9.6安装

python3的安装wget "https://www.python.org/ftp/python/3.6.3/Python-3.6.3.tgz"tar zxf Python-3.6.3.tgzcd Python-3.6.3/./configure --prefix=/usr/bin/python3make && make installln -s /opt/tools/Python-3.6.3/bin/python3.6 /usr/bin/python3ln -s /opt/

2021-08-14 14:55:50 1389

原创 Conda安装,yyds,安装最新版本R和R包devtools

安装conda为啥要安装conda呢?因为要安装软件,我们自己的服务器集群是我在读研究生之前就组好的,由于一些底层环境无法更新,主要还是要适配以前的一些软件,更新以后有可能会出现冲突,但是它又不能支持编译新的软件,这个冲突的解决就需要conda。conda可以自己创建一个软件环境,虽然有人说过会有污染自己以前软件库的嫌疑(比如这篇文章:http://www.bio-info-trainee.com/4030.html)。废话不多说,开始安装惯例哈,先上官网链接,miniconda官网链接:https:

2021-07-27 17:05:21 12937 3

原创 R包安装,devtools及其依赖包

安装R包这里以安装devtools,R包为例当然需要提醒一下,github上的R包需要自行下载迁移到服务器中才可以安装刚下载的最新版本的R-4.1.0,由于国内服务器的原因,无法连接到github上,但是作为一名生信工作者又不得不使用,所以建议先安装devtools这个R包,可以很好的帮助你安装一些R包## (可以忽略)设置清华大学为下载镜像地址options(repos=structure(c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))

2021-07-16 14:47:57 41045

原创 linux版本最新R4.1.0自行安装

linux版本R4.1.0安装(适用于最新版本R)下载并解压R4.1.0configure命令检查有可能会出现的问题:pcre版本过低及解决办法(pcre的安装及configure命令使用)make && make install(当然分开执行也是一样的)下载并解压R4.1.0从R官网(https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/index.html)下载最新的R包,将其上传到linux服务器中,或者使用wget命令下载。## 下载并解压文件w

2021-05-24 16:06:28 6074 2

空空如也

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