【saVic】[InSAR - 环境配置篇 - 2]在Ubuntu20.04下安装GAMMA（v2020/2022）

在Ubuntu20.04下安装GAMMA（v2020/2022）

saVic @2022/7/19

1 前言

GAMMA 合成孔径雷达干涉测量软件是由瑞士GAMMA公司开发的用于干涉雷达数据处理的全功能软件平台，运行在Linux系统下。
本文将介绍本人在武大雷达遥感项目组的电脑上（Ubuntu20.04）安装GAMMA（v20200728）的方法。
2023.4.26更新：最新的v2022版GAMMA也适用

主要参考为：

• GAMMA（v20200728）官方安装文档INSTALL_Linux.html
• CSDN《Linux Ubuntu20.04 版本下安装 GAMMA 2020版 安装步骤 安装教程》作者：珠峰上的蓝天，链接：https://blog.csdn.net/qq_38372838/article/details/110188072

2 准备软件包

GAMMA软件是商业软件。首先准备GAMMA（v20200728）的安装包，需要注意获取到的安装包属于哪种情况：

• 压缩包/解压文件：若拿到的GAMMA软件是压缩包，则需要将其解压到待安装的路径。若拿到的直接是解压后的文件，则直接将整个文件夹复制到待安装的路径。如/usr/local/GAMMA_SOFTWARE-20200728
• 源代码/已编译：若拿到的GAMMA软件只有源代码和makefile文件，则需要在配置好环境后使用make命令编译makefile文件。若拿到的GAMMA软件已经经过编译，则只需要配置好环境即可。

这里获取的软件为已解压、已编译的一个“GAMMA_SOFTWARE-20200728”文件夹。因此将其直接拷贝到待安装的路径下即可。

3 添加环境变量

需要将GAMMA软件的目录添加到环境变量下，才可以在任意目录下执行其中的代码。
环境变量可以在bashrc中进行设置，首先打开bashrc文件：

 sudo gedit ~/.bashrc

在文件的最后添加如下内容。其中，GAMMA软件路径“GAMMA_HOME”和默认文件格式“GAMMA_RASTER”根据实际情况修改：

########## saVic #########

# GAMMA
export GAMMA_HOME=/home/savic/saVic/Software/Gamma/GAMMA_SOFTWARE-20200728 ### TODO：请根据实际情况修改路径
export MSP_HOME=$GAMMA_HOME/MSP
export ISP_HOME=$GAMMA_HOME/ISP
export DIFF_HOME=$GAMMA_HOME/DIFF
export DISP_HOME=$GAMMA_HOME/DISP
export LAT_HOME=$GAMMA_HOME/LAT
export IPTA_HOME=$GAMMA_HOME/IPTA
export GEO_HOME=$GAMMA_HOME/GEO

# PATH
export PATH=$PATH:.:$MSP_HOME/bin:$ISP_HOME/bin:$DIFF_HOME/bin:$LAT_HOME/bin:$DISP_HOME/bin:$IPTA_HOME/bin:\
$MSP_HOME/scripts:$ISP_HOME/scripts:$DIFF_HOME/scripts:$LAT_HOME/scripts:$IPTA_HOME/scripts:$DISP_HOME/scripts:\

export OS=linux64
#This adds the Gamma Software main directory to the Python path
export PYTHONPATH=.:$GAMMA_HOME:$PYTHONPATH
#This command disables version checking for HDF5
export HDF5_DISABLE_VERSION_CHECK=1
#This sets the Gnuplot default terminal type to be QT
export GNUTERM=qt
#Alternately, this sets the default terminal type to be WXT
#export GNUTERM=wxt
#set default raster format to BMP
export GAMMA_RASTER="BMP" ### TODO：请修改默认文件格式为SUN_RASTER、BMP或TIFF

添加完成后保存文件，并通过以下命令将环境变量刷新：

 source ~/.bashrc

4 安装依赖库

GAMMA软件需要安装一系列依赖库才能运行。
Linux系统中可以通过sudo apt(-get) install [软件名]安装软件。

4.1 安装FFTW3

Ubuntu系统下的安装方式为：

 sudo apt install libfftw3-dev libfftw3-single3

结果：成功安装无报错

4.2 安装Gnuplot与GIMP

Ubuntu系统下的安装方式为：

 sudo apt install gnuplot gnuplot-data gimp

结果：成功安装无报错

4.3 安装GTK 2+

Ubuntu系统下的安装方式为：

 sudo apt install libgtk2.0-dev

结果：成功安装无报错

4.4 安装GDAL

2023.4.26更新：该方式已过时，请跳过

首先添加Debian软件包（网址：https://packages.debian.org/）源，以便apt可以搜索到各个版本的GDAL。

1. 打开软件源列表文件：sudo gedit /etc/apt/sources.list
2. 在文件最后添加一行：deb http://ftp.de.debian.org/debian buster main
3. 添加秘钥：sudo apt-key adv --keyserver hkp://keyserver.ubuntu.com:80 --recv 648ACFD622F3D138 0E98404D386FA1D9 DCC9EFBF77E11517
4. 更新软件源：sudo apt-get update

Ubuntu系统下安装GDAL：

 sudo apt install gdal-bin libgdal-dev libgdal20 

结果：依赖问题，无法安装
解决：可以先安装gdal-bin、libgdal-dev，但libgdal20仍有依赖问题。此时暂不需解决依赖问题，发现在安装gdal-bin、libgdal-dev的过程中安装了libgdal26。事实上，后续发现GAMMA（v20200728）需要的正是libgdal26而不是libgdal20。为了确保，可以在成功安装gdal-bin、libgdal-dev后前往/lib目录查看有无GAMMA需要的文件“libgdal.so.26”。

2023.4.26更新：最新的v2022版GAMMA安装文档里发现了这一问题，现在官方指出的安装方式就是：

 sudo apt install gdal-bin libgdal-dev 

4.5 安装HDF5

2023.4.26更新：该方式已过时，请跳过

Ubuntu系统下的安装方式为：

  sudo apt install libhdf5-dev libhdf5-100

结果：libhdf5-dev成功安装，libhdf5-100无此包，已被libhdf5-103代替
解决：安装libhdf5-103：

  sudo apt install libhdf5-103

2023.4.26更新：最新的v2022版GAMMA安装文档里发现了这一问题，现在官方指出的安装方式就是：

 sudo apt install libhdf5-dev libhdf5-103

4.6 安装LAPACK和BLAS

Ubuntu系统下的安装方式为：

 sudo apt install libblas-dev libblas3 liblapack-dev liblapack3

结果：成功安装无报错
注：官方推荐安装liblapack-doc，但未找到此包，不过没有什么影响

5 编译代码（跳过）

注：若拿到的GAMMA软件只有源代码和makefile文件，则需要在配置好环境后使用make命令编译makefile文件。（一般获取到的都是编译好的）
首先安装GCC编译器：

sudo apt install build-essential

依次编译DISP/src, ISP/src, MSP/src, DIFF/src, IPTA/src, LAT/src目录下的makefile_static文件。既可以手动前往每个目录运行命令，也可以在任意目录通过刚刚配置的环境变量cd进入。

cd $DISP_HOME/src
make -f makefile_static
### TODO：需进入DISP/src, ISP/src, MSP/src, DIFF/src, IPTA/src, LAT/src每个目录运行

6 完成并测试效果

安装过程到此完成。
GAMMA官方安装文档提供了如下两种测试方法，在任意位置打开终端输入命令：

• disras
• gamma_doc data2geotiff

事实上，在任意位置输入任意GAMMA命令，只要成果返回该函数输入输出参数的介绍并没有报错，即可基本认为配置没问题。以输入disras为例：

后续会介绍在Ubuntu20.04下安装StaMPS(v4.1)。

注意，上述安装方式都是在官方文档推荐的系统下（Ubuntu20.04）进行的，如果系统版本不一样，可能会造成部分依赖包的版本与GAMMA需要的不一致，导致出现问题。

7 补充内容

2023.4.26补充：虽然文档中到前面这一步已经安装好了，但GAMMA数据处理过程中还要用到一些其他内容，这里一并补充出来：

7.1 安装csh（或tcsh）

批处理脚本通常使用csh编写，安装方式为：

 sudo apt install csh

或：

 sudo apt install tcsh

脚本中通常需要用到gawk：

 sudo apt install gawk

7.2 python环境

GAMMA部分功能（例如哨兵1号影像配准S1_Coreg.py是用python写的）需要用到python环境。
官方指出：推荐使用python3，但他们已经测试了在2上也能用。
Ubuntu系统自带python3，可以通过以下命令确认：

 python --version

如果确实没有，通过以下命令安装：

 sudo apt install python3

如果装了多个版本的python，可以通过下面的方式指定使用python3：

 sudo apt install python-is-python3

最后，安装GAMMA需要的python包。
如果没有python包管理器pip，则安装：

 sudo apt install pip

以下为GAMMA处理过程中需要用到的包，建议一个一个安装，以便pip可以自动解决包与包之间的版本依赖问题：

 sudo pip install numpy 
 sudo pip install matplotlib 
 sudo pip install scipy 
 sudo pip install shapely 
 sudo pip install packaging