【saVic】[InSAR - 环境配置篇 - 3]在Ubuntu20.04下安装StaMPS（v4.1）

在Ubuntu20.04下安装StaMPS（v4.1）

saVic @Shiyan, 2022/7/26

1 前言

StaMPS是一个主要基于Matlab的InSAR软件包，允许从合成孔径雷达采集的时间序列中提取地面形变。该软件包结合了PS和SBAS方法，以及结合这两种方法的选项。
本文将介绍本人在武大雷达遥感项目组的电脑上（Ubuntu20.04）安装StaMPS（v4.1）的方法。
主要参考为：

• StaMPS官方文档
• CSDN《StaMPS4.1+ISCE2.5安装记录》作者：boost66
  ，链接：https://blog.csdn.net/ZB18810657133/article/details/115770853

2 准备软件包

StaMPS软件共需要：

• 支持：Matlab
• 本体：StaMPS
• 必须依赖：Snaphu
• 可选依赖：TRAIN、Triangle

获取软件包的方式有两种，相应的安装方法也不同：

1. 在官网/Github获取未编译的源码。这种方法需要使用GCC编译器通过make命令编译。
   – 安装GCC编译器：

   sudo apt install build-essential
   

   – 编译代码（以StaMPS为例，其他类似）：

   cd /StaMPS-4.1-beta/src
   make
   sudo make install
   

   下载链接：
   StaMPS https://github.com/dbekaert/StaMPS
   Snaphu https://web.stanford.edu/group/radar/softwareandlinks/sw/snaphu/
   TRAIN https://github.com/dbekaert/TRAIN
   方法1可以主要参考：https://blog.csdn.net/ZB18810657133/article/details/115770853
2. 直接获取编译好的程序。这种方法只需要把软件文件放好在某个地方，然后配置好环境变量bashrc并添加matlab路径即可。
   –本人的StaMPS软件及依赖由武大雷达遥感项目组提供，拿到的软件为已解压、已编译的一个文件夹。因此本文主要介绍方法2。
   –若不想在Github下载源码编译，方法2用到的StaMPS（v4.1）+Snaphu（v1.4.2）+TRAIN已放在：https://pan.baidu.com/s/1C8vnQDmfwclfK5WM4Ls6Og?pwd=gzi2（注：此文件中的StaMPS中某些Matlab代码已被项目组成员修改过一些BUG，如不需要请尽量下载上面的原版。Snaphu和TRAIN没问题。）

3 安装

3.1 安装Matlab

StaMPS软件基于Matlab，因此需要安装Matlab。

3.2 安装StaMPS

将StaMPS软件和Snaphu、TRAIN的三个文件夹“StaMPS-4.1-beta”、“snaphu-v1.4.2”、“TRAIN-master”拷贝至适当的位置，例如本人这里放在了

/home/savic/saVic/Software/Stamps/StaMPS-4.1-beta
/home/savic/saVic/Software/Stamps/snaphu-v1.4.2
/home/savic/saVic/Software/Stamps/TRAIN-master

对于Triangle，可以直接使用apt命令安装：

sudo apt-get install triangle-bin

3.3 配置环境变量bashrc

环境变量可以在bashrc中进行设置，首先打开bashrc文件：

 sudo gedit ~/.bashrc

找到PATH变量export PATH=$PATH:.:（安装GAMMA软件时应已添加），在其上面的位置添加：

# TODO：需根据实际位置填写
export STAMPS_HOME=/home/savic/saVic/Software/Stamps/StaMPS-4.1-beta
export SNAPHU_HOME=/home/savic/saVic/Software/Stamps/snaphu-v1.4.2
export TRAIN_HOME=/home/savic/saVic/Software/Stamps/TRAIN-master

然后，在PATH变量export PATH=$PATH:.:的最后添加上述三个软件的bin目录：

$STAMPS_HOME/bin:$SNAPHU_HOME/bin:$TRAIN_HOME/bin

如果PATH变量太长需要换行，在行末尾添加:\

StaMPS环境变量添加好后，和GAMMA的环境变量一起，在bashrc文件中可以整理如下：（举例展示，以实际安装路径为准）

########## saVic #########

# GAMMA
export GAMMA_HOME=/home/savic/saVic/Software/Gamma/GAMMA_SOFTWARE-20200728
export MSP_HOME=$GAMMA_HOME/MSP
export ISP_HOME=$GAMMA_HOME/ISP
export DIFF_HOME=$GAMMA_HOME/DIFF
export DISP_HOME=$GAMMA_HOME/DISP
export LAT_HOME=$GAMMA_HOME/LAT
export IPTA_HOME=$GAMMA_HOME/IPTA
export GEO_HOME=$GAMMA_HOME/GEO

# STAMPS
export STAMPS_HOME=/home/savic/saVic/Software/Stamps/StaMPS-4.1-beta
export SNAPHU_HOME=/home/savic/saVic/Software/Stamps/snaphu-v1.4.2
export TRAIN_HOME=/home/savic/saVic/Software/Stamps/TRAIN-master

# PATH
export PATH=$PATH:.:$MSP_HOME/bin:$ISP_HOME/bin:$DIFF_HOME/bin:$LAT_HOME/bin:$DISP_HOME/bin:$IPTA_HOME/bin:\
$MSP_HOME/scripts:$ISP_HOME/scripts:$DIFF_HOME/scripts:$LAT_HOME/scripts:$IPTA_HOME/scripts:$DISP_HOME/scripts:\
$STAMPS_HOME/bin:$SNAPHU_HOME/bin:$TRAIN_HOME/bin

export OS=linux64
#This adds the Gamma Software main directory to the Python path
export PYTHONPATH=.:$GAMMA_HOME:$PYTHONPATH
#This command disables version checking for HDF5
export HDF5_DISABLE_VERSION_CHECK=1
#This sets the Gnuplot default terminal type to be QT
export GNUTERM=qt
#Alternately, this sets the default terminal type to be WXT
#export GNUTERM=wxt
#set default raster format to BMP
export GAMMA_RASTER="BMP"

添加完成后保存文件，并通过以下命令将环境变量刷新：

 source ~/.bashrc

3.4 添加Matlab路径

打开Matlab > 设置路径，使用“添加并包含子文件夹”按钮将上面三个软件的文件夹添加至路径中：

/home/savic/saVic/Software/Stamps/StaMPS-4.1-beta
/home/savic/saVic/Software/Stamps/snaphu-v1.4.2
/home/savic/saVic/Software/Stamps/TRAIN-master

为了省事，这里直接选择了三个软件的上级目录/home/savic/saVic/Software/Stamps。
提示：添加完Matlab后要注意是否保存，当心每次启动Matlab是否会重置默认目录。

4 测试

在任意位置打开终端，输入mt_prep_gamma或snaphu等命令，检查环境变量bashrc的设置。输出命令介绍且无报错即可。


在任意目录下运行Matlab，输入stamps --version，检查Matlab路径的设置。输出stamps版本信息且无报错即可。

【完】