近日,阿里云对外宣布其容器服务调度GPU云服务器启动加速计算,最快只需60秒即可完成新冠病毒的核酸对比工作;同时将向医疗科研机构、疾控中心等一线病毒研究机构免费开放基因计算服务,技术可大幅提升宏基因组测序、疫苗研发相关的处理效率。
基于此,晶少专程采访了阿里云基因计算服务AGS负责人、高级技术专家李鹏,集中呈现针对GPU和容器技术大幅提升核酸比对速度的有关细节以及关于阿里云基因计算服务(AGS)的诸多信息。
据晶少了解,本次阿里云基因计算服务AGS病毒比对能力-mNGS宏基因组比对从设计、研发、验证到最终上线只用了短短20几天,但李鹏所在团队却每天肩负着艰苦卓绝的工作。很关键的一个出发点在于,除了提供针对新冠肺炎病毒中mNGS宏基因组测序数据的快速比对能力之外,更重要的是让研究机构更专注业务创新,而不是数据本身的重复处理工作,这其中就涉及到了生物类型计算解决方案所具有的鲜明特殊性。
晶少:生物计算解决方案有一定的特殊性,相比其他类型的技术解决方案有何不同?
阿里云基因计算服务AGS负责人、高级技术专家李鹏:不同于常规的计算,基因计算对海量数据计算和存储能力有很高的要求,主要通过容器计算的自动伸缩特性和阿里云ECS自动伸缩能力