【AHOI2006】bzoj1264 基因匹配

Description 基因匹配（match）
卡卡昨天晚上做梦梦见他和可可来到了另外一个星球，这个星球上生物的DNA序列由无数种碱基排列而成（地球上只有4种），而更奇怪的是，组成DNA序列的每一种碱基在该序列中正好出现5次！这样如果一个DNA序列有N种不同的碱基构成，那么它的长度一定是5N。
卡卡醒来后向可可叙述了这个奇怪的梦，而可可这些日子正在研究生物信息学中的基因匹配问题，于是他决定为这个奇怪星球上的生物写一个简单的DNA匹配程序。
为了描述基因匹配的原理，我们需要先定义子序列的概念：若从一个DNA序列（字符串）s中任意抽取一些碱基（字符），将它们仍按在s中的顺序排列成一个新串u，则称u是s的一个子序列。对于两个DNA序列s1和s2，如果存在一个序列u同时成为s1和s2的子序列，则称u是s1和s2的公共子序列。
卡卡已知两个DNA序列s1和s2，求s1和s2的最大匹配就是指s1和s2最长公共子序列的长度。 [任务] 编写一个程序： 
从输入文件中读入两个等长的DNA序列；  计算它们的最大匹配；  向输出文件打印你得到的结果。 Input
输入文件中第一行有一个整数N，表示这个星球上某种生物使用了N种不同的碱基，以后将它们编号为1…N的整数。
以下还有两行，每行描述一个DNA序列：包含5N个1…N的整数，且每一个整数在对应的序列中正好出现5次。 Output
输出文件中只有一个整数，即两个DNA序列的最大匹配数目。

裸的LCS用dp是$O(n^2)$的。
利用dp矩阵逐行考虑，注意到每个数只会出现五次，每一行匹配的位置是常数级别的，而只有这些位置可以更新答案。因此只需要对这些点进行处理。需要的操作就是询问前缀最大值，用树状数组维护，复杂度$O(n\log n)$。

#include<cstdio>
#include<cstring>
#include<algorithm>
using namespace std;
int rd()
{
    int x=0;
    char c=getchar();
    while (c<'0'||c>'9') c=getchar();
    while (c>='0'&&c<='9')
    {
        x=x*10+c-'0';
        c=getchar();
    }
    return x;
}
int n,f[20010][5],now[20010],a[100010],mx[100010];
int qry(int p)
{
    int ret=0;
    for (;p;p-=p&-p) ret=max(ret,mx[p]);
    return ret;
}
void upd(int p,int x)
{
    for (;p<=n*5;p+=p&-p) mx[p]=max(mx[p],x);
}
int main()
{
    int x;
    n=rd();
    for (int i=1;i<=n*5;i++) a[i]=rd();
    for (int i=1;i<=n*5;i++)
    {
        x=rd();
        f[x][++now[x]]=i;
    }
    for (int i=1;i<=n*5;i++)
        for (int j=5;j;j--)
            upd(f[a[i]][j],qry(f[a[i]][j]-1)+1);
    printf("%d\n",qry(n*5));
}