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原创 dbNSFP4.6a整理成snpeff需要的文件

【代码】【无标题】

2024-03-01 13:32:33 397

原创 GATK创建索引

序列是经过index的,而且需要两个index文件,一个是后缀名为。的,缺少这些文件,或者两个文件中的内容不一致都可能导致程序报错。的,另外一个是后缀名称为。

2023-08-07 16:19:02 1053

原创 endNote显示期刊的文章分数

需求和解决endNote本身无法显示期刊的影响因子,但是我们可以转换思路,让其在Preview部分的期刊部分显示期刊的影响因子步骤一、期刊影响因子的相关数据的下载和处理 在web of sciece(https://esi.clarivate.com/DocumentsAction.action)下载相关领域的数据,处理成endnote term lists需要的格式。...

2019-09-25 08:00:22 2549 1

原创 蛋白质芯片查找与GEO2R进行初步分析

1、蛋白质芯片查找GEO网站:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds检索词:Pancreatic cancer;Protein profiling by protein array 我们可以看到搜索结果为11个,选择第一个数据GSE29676作为分析的数据集;该数据集共609个样本,平台为13669,点击Analyze with GEO2...

2019-04-16 17:14:19 4555

原创 avrdude: ser_open(): can't open device "/dev/ttyUSB0": Permission denied

chmod 777 /dev/ttyUSB0

2019-04-12 07:07:09 3912 1

原创 如何下载人类的参考基因组和注释文件

参考基因组概况参考基因组下载的网站主要有3个NCBI,Ensembl,UCSC,一般参考基因组的.gz压缩文件文件大小为900M以上不超过950M,解压后大于等于3G. 基因组的主要版本对应关系参考基因组下载过程UCSC下载参...

2019-04-10 15:22:27 18831 1

原创 pymol学习实验记录

平台:ubuntu18.10 x64位一:什么是pymolPyMOL软件以Py+MOL命名:“Py”表示它是由一种计算机语言Python所衍生出来的,“MOL”表示它是用于显示分子(英文为molecule)结构的软件。PyMOL适用于创作高品质的小分子或是生物大分子(特别是蛋白质)的三维结构图像。软件的作者宣称,在所有正式发表的科学文献中的蛋白质结构图像中,有四分之一是使用PyMO...

2019-03-19 14:06:28 3868

Journal_List_Impact_factor.txt

#================生物类相关期刊的缩写=========== CA: A CANCER JOURNAL FOR CLINICIANS CA Cancer J. Clin. CA Cancer J Clin CA Cancer J Clin. 187.04; 131.723; 115.84; 162.5. NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE New Engl. J. Med. N Engl J Med N Engl J Med. 72.406; 59.558; 55.873; 54.42. NATURE REVIEWS DRUG DISCOVERY Nat Rev Drug Discov Nat Rev Drug Discov Nat Rev Drug Discov. 57; 47.120; 41.908; 37.231. CHEMICAL REVIEWS Chem. Rev. Chem Rev Chem Rev. 47.928; 37.369; 46.568; 45.661. LANCET Lancet Lancet Lancet. 47.831; 44.002; 45.217; 39.207.

2019-09-25

JournalHomeGrid.csv

#==============2018生物类年期刊文章影响因子==================== "Journal Data Filtered By: Selected JCR Year: 2018 Selected Editions: SCIE,SSCI Selected Category Scheme: WoS",,,, Rank,Full Journal Title,Total Cites,Journal Impact Factor,Eigenfactor Score 1,CA-A CANCER JOURNAL FOR CLINICIANS,"32,410",223.679,0.077370 2,Nature Reviews Materials,"7,901",74.449,0.033870 3,NEW ENGLAND JOURNAL OF MEDICINE,"344,581",70.670,0.686700 4,LANCET,"247,292",59.102,0.427870 5,NATURE REVIEWS DRUG DISCOVERY,"32,266",57.618,0.054890

2019-09-25

空空如也

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