R绘制文章标题词云

本文介绍了如何使用R语言绘制2018年TCGA泛癌项目以及2020年Nature子刊全基因组泛癌分析论文的标题词云。首先,通过解析网页HTML获取论文标题数据,然后详细阐述了词云的绘制过程,提供了相关参考资料。
摘要由CSDN通过智能技术生成

数据和问题

见:把tcga大计划的CNS级别文章标题画一个词云

词云绘制

关于词云绘制较详细的步骤可以参考,之前的博文 https://blog.csdn.net/shy_321/article/details/120567111

2018的TCGA的泛癌项目论文

获取数据

文章的标题都在该网页里,
(https://www.cell.com/pb-assets/consortium/pancanceratlas/pancani3/index.html )
可以选择使用复制粘贴的方式(数据不是很多) 或者, 直接解析该网页html的内容,提取标题。
这里采用网页解析的方式。

install.packages("rvest") ###rvest 是R中的一个爬虫包

library(rvest)

### 读取网页, 本来 read_html是可以直接输入url的
### 但是,可能网络原因,或者其他原因把,并不能成功读取
### 所以手动在浏览器上打开 https://www.cell.com/pb-assets/consortium/pancanceratlas/pancani3/index.html ,
### 然后保存网页为tcga_cancer.html, 在读取
html <- read_html("tcga_cancer.html")

#### 这两行,是为了得到标题内容
sections <- html %>% html_nodes("section")
titles <- sections[2:4]  %>%
    html_nodes("ul > li.journal + li > a")  %>% html_text()

titles    
-----------
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