DrugLLM：基于大语言模型的药物分子性质分析平台

最新推荐文章于 2024-08-12 22:49:39 发布
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分类专栏： 项目实训 文章标签： python
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本文深入探讨了山东大学软件学院三年级学生的下学期项目实训课程，包括其具体内容、目标和实践经验分享。
摘要由CSDN通过智能技术生成

本篇文章用于介绍山东大学软件学院大三下项目实训有关内容

silence_li_
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专栏目录
山东大学软件学院创新项目实训DrugLLM-基于大语言模型的药物分子性质分析平台（八）
m0_63482308的博客
06-24 196
是一个涉及毒理学研究的倡议和项目。Tox21计划旨在开发和验证新的高效毒理学测试方法，以更快速、更有效地评估化学物质的。在药物研究中，HIV通常用于评估药物对HIV感染和复制的抑制能力，可能是针对。：是一个数据库，收集了药物使用过程中可能发生的不良反应信息。在药物研究中，通常用于评估。：是指药物在临床试验中可能引起的毒性反应或不良反应。为了配合前台的“使用说明”页面，编写了性能分析的管理。：是一个计划和平台，通过高通量筛选技术来预测化学物质的。，这些抑制剂被研究作为阿尔茨海默病的潜在治疗药物。
山东大学软件学院创新项目实训DrugLLM-基于大语言模型的药物分子性质分析平台（一）
m0_63482308的博客
04-08 1200
训练过程中采用指令微调策略，将一般知识和分子优化领域的数据混合，并采取一定的比例复制较少的数据类别以达到平衡，从而有效缓解模型在微调阶段的灾难性遗忘问题。当模型提供的分子未能完全满足要求时，它能够根据人类提供的符合标准的示例纠正错误并生成新的合规分子，这凸显了DRUGAssist在现实世界中辅助研究人员不断调整和优化分子结构的巨大潜力。③多模态融合：部分研究探索结合分子的结构、性质和上下文文本信息，构建多模态分子语言大模型，以提升模型的理解和推理能力。，旨在推动未来LLMs在药物发现领域应用的研究进展。
山东大学DrugLLM开发团队 项目实训（一）项目概述
silence_li_的博客
04-05 1555
DrugLLM：基于大语言模型的药物分子性质分析平台，可用于研究人员进行药物相互作用预测、药物性质分析等提供支持。
山东大学软件学院创新项目实训DrugLLM-基于大语言模型的药物分子性质分析平台（二）
m0_63482308的博客
04-13 1235
此外，解码器还引入了“编码器-解码器注意力”子层，使得在生成法文单词时，能够直接聚焦于与之对应的英文输入序列中最具相关性的部分，如在生成“monde”时重点参考“world”的表示。这种设计使得模型能够并行处理输入序列中的所有元素，极大地提高了训练速度和计算效率。Transformer凭借其创新的多头自注意力机制、自回归解码结构以及强大的并行计算能力，成功克服了传统序列模型在处理长距离依赖时的局限性，极大地提升了翻译质量和训练效率，为自然语言处理领域的模型设计树立了新的标杆，并启发了一系列后续研究与应用。
山东大学软件学院创新项目实训DrugLLM-基于大语言模型的药物分子性质分析平台（三）
m0_63482308的博客
04-22 516
本周在已经搭建好的前后端框架上，站在用户的角度分析设计需求，进一步完善了DrugLLM系统的功能和非功能性需求，并在前端页面上做了进一步的美化。：DrugChat利用NLP技术来理解用户输入的自然语言，通过分词、词性标注、命名实体识别等技术，将用户提出的问题或输入的信息转化为计算机可以理解和处理的形式。：DrugChat模型采用机器学习和深度学习技术来不断优化其性能，通过大量的数据训练模型，使其能够更准确地理解用户输入，并提供更精准的药物信息和建议。这可以通过工具自动化实现，例如Webpack的。
山东大学软件学院创新项目实训DrugLLM-基于大语言模型的药物分子性质分析平台（十）
m0_63521375的博客
06-24 291
本周主要负责实现论文管理的后端处理，为方便对后台中论文的管理以及前台页面中论文的展示，在后端中实现相关方法，建立数据库来实现前端这些数据的获取，同时实现了前台页面中个人信息和修改密码信息界面的实现。首先建立实体类，创建数据库表，将相关的论文数据爬虫导入，之后利用实现增删改查方法，设计接口，供前端使用。
山东大学软件学院创新项目实训DrugLLM-基于大语言模型的药物分子性质分析平台（九）
m0_63521375的博客
06-24 163
函数将SMILES字符串转换为图形表示，如果转换失败（通过捕获异常），则打印出该SMILES字符串并增加计数器。本周主要任务是处理模型使用的数据，读json文件，存储到一个pickle文件中。列表中，打印出跳过的SMILES数量（即转换失败的SMILES数量），将。中），将词频向量和图形表示作为一个字典添加到。中导入，用于将文本数据转换为词频矩阵；中的每个文本和SMILES对，尝试使用。中，提取JSON中的文本部分（即。，用于存储转换后的数据，遍历。中的文本转换为词频矩阵。的pickle文件中。
大模型微调工具-torchtune
weixin_40777649的博客
08-08 907
1.定义2.安装3. 案例。
Python 算法交易实验80 QTV200日常推进-目标估算
yukai08008的博客
08-10 441
业务目标在先，月利3%是第一个目标。虽然日常有在常规推进，但目标是什么？现在做的是什么？与目标的关联是什么？业务上讲，如果月利能够达到3%(几何平均)，上下波动不超过1%，就算达标了(2%~4%)。考虑到金融领域有不可测风险，所以资金还会分摊到3个月。例如，假如总投资资金是30万，那么每个月的最大投资金额是10万。这样即使遇到大跳水，问题也不大。目标达到的话，10万本金每月的盈利是3000， 按复利计,24个月就会double，我觉得已经足够理想。假设投资90万，则可以按30万计算复利效果。
网络安全入门教程（非常详细）从零基础入门到精通，看完这一篇就够了。
2401_84466359的博客
08-12 355
这个方向更符合于大部分人对“黑客”的认知，他们能够黑手机、黑电脑、黑网站、黑服务器、黑内网，万物皆可黑（当然是要有授权的，不然进橘子我可不管），这个方向初期比较容易入门一些，掌握一些基本技术，拿起各种现成的工具就可以开黑了。是一种面向对象、直译式电脑编程语言，具有近二十年的发展历史，成熟且稳定。压箱底的好资料，全面地介绍网络安全的基础理论，包括逆向、八层网络防御、汇编语言、白帽子web安全、密码学、网络安全协议等，将基础理论和主流工具的应用实践紧密结合，有利于读者理解各种主流工具背后的实现机制。
NVIDIA-CUDA
qq_41081716的博客
08-08 427
CUDA 是一种强大的并行计算平台，它极大地扩展了 GPU 的用途，使其不仅仅局限于图形处理。通过利用 CUDA，开发人员可以编写高效、高性能的并行应用程序，这些应用程序可以用于各种计算密集型任务。如果您正在从事高性能计算或需要加速计算任务的工作，CUDA 是一个非常有用的工具。
Falsk测试与部署（第九阶段）
蜡笔小新星的博客
08-09 632
在本章节中，我们学习了如何使用unittest和pytest进行单元和集成测试，以及如何配置Flask应用，使用WSGI服务器部署，容器化Flask应用并将其部署到各种云服务平台。通过这些步骤，你可以确保你的Flask应用在生产环境中的稳定性和可靠性。希望这些知识能够帮助你在实际项目中更好地实现测试和部署。
《python语言程序设计》2018版第6章第42题Turtle：绘制sin函数，使用程序清单6-14中的函数简化5.52代码
电饭叔
08-10 266
在output06th.py中的代码。
python识别车辆标志
weixin_45570158的博客
08-09 418
要使用Python来识别车辆标志，你通常会用到计算机视觉库，如OpenCV，结合深度学习框架如TensorFlow或PyTorch。这里我将提供一个基于OpenCV和TensorFlow（使用预训练模型，如MobileNetV2）的基本示例。
【Python】python中抽象类学习笔记
最新发布
qq_42761751的博客
08-12 136
抽象类是一个不能被实例化的类，通常作为其他类的基类抽象方法是一个没有具体实现的方法一个抽象类可以有或者没有抽象方法, 但是一般来说定义抽象类的时候总会在类中定义抽象方法Python并没有直接支持抽象类，但是提供了一个模块（abc）来允许定义抽象类通过继承abc.ABC类定义一个抽象类pass上述代码中类虽然继承了ABC但是没有定义抽象方法，仍然可以被实例化。"""使用@abstractmethod来定义抽象方法"""passmain()代码报错：不能实例化一个带有抽象方法的抽象类。
windows下wsl ubuntu 搭建深度学习环境
qq_35661896的博客
08-11 500
删除之前安装的ubuntu;查看都安装了哪些版本：wsl -l -v删除想要删除的版本：wsl --unregister ${名字}删除之后 ubuntu.exe的安装包还在c盘中， 找到它， 并将 ubuntu.exe的所在文件夹的所有文件都复制到你想要安装的新的路径下，比如我在E盘新创建一个文件夹： E:\wsl_ubuntu_20.04，复制过去后如下：然后卸载c盘的ubuntu；
pytest-bdd 行为驱动自动化测试
Dingdangr的博客
08-08 907
1. 定义pytest-bdd是一个轻量级的测试库，旨在为pytest测试框架添加Gherkin语言支持，帮助开发者以更自然、更易于理解的方式编写和执行BDD测试。2. 核心特点无缝融合：pytest-bdd将BDD的描述性和pytest的灵活性完美融合，使得测试过程既直观又灵活。Gherkin支持：通过Gherkin语言，开发者可以使用自然语言来描述测试场景和步骤，提高测试的可读性和可维护性。装饰器映射。
leetcode:1822. 数组元素积的符号(python3解法)
qq_41905051的博客
08-09 380
leetcode:1822. 数组元素积的符号(python3解法)
利用python写一个可视化的界面
huanghm88的专栏
08-08 3101
这段代码创建了一个窗口，并在窗口中添加了一个标签和一个按钮。当按钮被点击时，标签的文本会变成"Hello, World!你可以根据自己的需求修改窗口的布局和添加其他控件。要利用Python编写一个可视化界面，你可以使用一些图形库来实现，例如Tkinter、PyQt、wxPython等。
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