R记录本
文章平均质量分 58
sinat_18722475
这个作者很懒,什么都没留下…
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写好R代码
写好R代码和写好 约瑟夫·里克特如果你渴望写出好的R代码,你可能会发现偶尔花一些时间阅读关于写作:阅读关于编写R代码,阅读关于写你写的R代码是有帮助的。 (如果你写了一些优秀的R代码,你很可能有机会写它。) 对于阅读关于编写好的R代码,一个开始的地方可能是许多R风格指南之一。 哈德利韦翰包括风格指南在他的预研书是短暂的甜蜜,并根据唯一略显不足简洁谷歌的ř风格指南 。 也看看格雷厄姆·威廉姆斯翻译 2017-01-15 15:56:23 · 505 阅读 · 0 评论 -
R-list-to-data-frame列表转数据框
Assuming your list of lists is calledl:df <- data.frame(matrix(unlist(l), nrow=132, byrow=T))The above will convert all character columns to factors, to avoid this you can add a parameter to the data.f转载 2017-01-15 15:57:59 · 27595 阅读 · 0 评论 -
画图-字体设置
函数pdf(或win.metafile)中加入famil="..."可以设置字体。可用的字体除了”sans”,”mono”,”serif”外还有 “AvantGarde”, “Bookman”, “Courier”, “Helvetica”, “Helvetica-Narrow”, “NewCenturySchoolbook”, “Palatino” or “Times”。但这个函数的设置是全局性原创 2017-01-15 15:25:50 · 646 阅读 · 0 评论 -
nei遗传距离聚类树
[TOC] 在R中计算Nei's遗传距离,并利用UPGMA获取聚类树的具体流程如下: 1. 在Excel中整理marker数据并用Genalex生成需要的格式后再在R中转成需要的“genind”对象类型。 1. 按照Genalex要求准备好原始数据(C4) 2. Genalex自动生成格式并保存成.csv Parameters>All for Codom (这是共显性标记,原创 2017-01-15 17:14:28 · 6869 阅读 · 2 评论 -
PCA
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)# setwd("C:/R/BB201608/pca")# install.packages("factoextra","rgl")library("factoextra")library("rgl")Dong.pca <- function(filename) { # read data df <- read.t原创 2017-01-15 19:13:13 · 446 阅读 · 0 评论