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原创 amber中使用TIP4P水模型参数文件的生成
TIP4P水模型在特定情况下会使用于分子动力学模拟之中,同时,本文只以TIP4P为例介绍非TIP3P水模型如何通过ambertools的leap模块构建参数文件。主要参照Amber2016 Reference Manual中3.5章节Solvents所介绍,给出一个tleap.in脚本样式,如下图:必须注意:使用leap产生的参数最好不要更换机器,实践证明,使用A机器生成参数而使用B机器进行后续运...
2018-04-25 15:10:11 1860
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