csr_matrix和csc_matrix简析

一、概念

csr_matrix(Compressed Sparse Row matrix)或csc_matric(Compressed Sparse Column marix),为压缩稀疏矩阵的存储方式。这里均以scipy包中的方法作为例子,具体可看:文档

二、简析

1、scipy.sparse.csr_matrix

>>> indptr = np.array([0, 2, 3, 6])
>>> indices = np.array([0, 2, 2, 0, 1, 2])
>>> data = np.array([1, 2, 3, 4, 5, 6])
>>> csr_matrix((data, indices, indptr), shape=(3, 3)).toarray()
array([[1, 0, 2],
       [0, 0, 3],
       [4, 5, 6]])

上述方式为按照row行来压缩
(1)data表示数据,为[1, 2, 3, 4, 5, 6]
(2)shape表示矩阵的形状
(3)indices表示对应data中的数据,在压缩后矩阵中各行的下标,如:数据1在某行的0位置处,数据2在某行的2位置处,数据6在某行的2位置处。
(4)indptr表示压缩后矩阵中每一行所拥有数据的个数,如:[0 2 3 6]表示从第0行开始数据的个数,0表示默认起始点,0之后有几个数字就表示有几行,第一个数字2表示第一行有2 - 0 = 2个数字,因而数字1,2都第0行,第二行有3 - 2 = 1个数字,因而数字3在第1行,以此类推。

2、scipy.sparse.csc_matrix

>>> indptr = np.array([0, 2, 3, 6])
>>> indices = np.array([0, 2, 2, 0, 1, 2])
>>> data = np.array([1, 2, 3, 4, 5, 6])
>>> csc_matrix((data, indices, indptr), shape=(3, 3)).toarray()
array([[1, 0, 4],
       [0, 0, 5],
       [2, 3, 6]])

上述方式为按照colums列来压缩,计算方式与按行类似。

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